第十三層是雅各之塔的最後一層。它由與雅各本人的三階段戰鬥所組成。也描述了完成模組後的獎勵，解釋了雅各之塔背後的秘密目的，並揭示了九(Nine)的真實身份。
第十三層包含了三位新的NPC數據表格和三隻新的怪物。
雅各之塔的最後一層可以是致命的。它有三場連續的APL 15戰鬥，一場具有挑戰性和嚴格的試煉，並非所有人都能取得勝利。如果你有一個強大、戰力優良或人數多的隊伍，那麼你可能可以讓他們停在等級12。但是如果你的隊伍人數較少或不那麼強大，你應該考慮把他們提升至等級13。
第十三層也可以重新調整為史詩級的三階段頭目戰給許多戰役使用。
雅各之塔的第十三層只能藉由購買雅各之塔整套的模組包獲得。整套模組包包含了改良後的內容、敵人、陷阱與戰鬥。除了第十三層: 術士與其他所有的模組外，還包含了擴展的前言，更深入地介紹了關於九以及內次元酒吧。