pip install GDAL
ではvenv環境ではうまく行かなかったので履歴をメモ
まず
$ sudo apt-get install libgdal-dev
その後
$ gdal-config --version
でバージョンを確認。2.2.3だったので
$ pip install pygdal=2.2.3.5
でインストールが成功。
pythonでの呼び出しは
>> from osgeo import gdal