II kooliaste hõlmab 4.-6. klassi õpet, mis lähtub sotsiaalkonstruktivistlikust ja transdistsiplinaarsest lähenemisest, võimaldades siduda eri õppeainete sisu ühisteks, globaalseteks teemadeks ja kujundada terviklikku maailmapilti. Õppimine toimub sotsiaalses suhtluses: õpilased arutavad, jagavad ideid ja konstrueerivad ühiselt arusaamu, õpetaja pakub aga sihipärast ja innustavat tuge ning juhendab õpilasi lähima arengu tsoonis. Õpilased õpivad tänu niisugusele lähenemisele seoseid looma ja infot otsima, allikakriitilisust ja loovat probleemilahendust.
II kooliastme tööd koordineerib vastava astme juht, kelle poole saab küsimuste korral pöörduda kooli kodulehelt leitava kontaktinfo kaudu.
Õpilastele lisandub II kooliastmes:
Tehnoloogia, käsitöö/kodundus. Valik kinnitatakse 3. klassi õppeaasta lõpus. Tehnoloogia ja kodundus/käsitöö ruumide kasutamine toimub ajaliselt kindlaks määratud vahetustega, põhiline õppesuund on valitud suunal.
B-võõrkeel, kus valida saab inglise, saksa, vene ja hispaania keele vahel. B-keele valik kinnitatakse 3. klassi õppeaasta lõpus.
Ajalugu (al 5. klassist)
Ühiskonnaõpetus (6. klass)
Kirjandus (al 5. klassist)