องค์กรระดับรัฐมนตรีอาเซียนสาขา (ASEAN Sectoral Ministerial Bodies) ดำเนินงานตามอำนาจหน้าที่ของแต่ละองค์กรที่มีอยู่ อนุวัติความตกลงและข้อตัดสินใจของที่ประชุมสุดยอดอาเซียนที่อยู่ในขอบข่ายการดำเนินงานของแต่ละองค์กร เสริมสร้างความร่วมมือในสาขาของแต่ละองค์กรให้เข้มแข็ง เพื่อสนับสนุนการรวมตัวของอาเซียนและการสร้างประชาคมอาเซียน เสนอรายงานและข้อเสนอแนะต่อคณะมนตรีประชาคมอาเซียนของแต่ละองค์กร องค์กรระดับรัฐมนตรีเฉพาะสาขา เช่น ด้านสาธารณสุข ด้านการศึกษา ด้านเศรษฐกิจและการเงิน เป็นต้น