Cùng với sự hình thành và phát triển của Phân loại học và Hệ thống học, sự phát triển của khoa học, trên cơ sở các bằng chứng tiến hóa như: bằng chứng hóa thạch, bằng chứng di truyền, bằng chứng hóa sinh,... các nhà hệ thống học đã phân chia sinh giới thành các giới khác nhau:
Carl Von Linné (1707-1778):
đã chia sinh giới thành 2 giới gồm giới động vật (Animalia) và thực vật (Plantae).
Ernst Haeckel (1866)
Trước khi Antonie van Leeuwenhoek phát minh ra kính hiển vi vào năm 1674, sự tồn tài của các vi sinh vật hoàn toàn không biết đến. Năm 1866, Haeckel trên cơ sở những đề xuất trước đó của Richard Owen và John Hogg đã phân chia sinh giới thành 3 giới gồm Nguyên sinh (Protoctista), Thực vật (Plantae), Động vật (Animalia).
Herbert F. Copeland (1938)
Với sự phát triển của khoa học, như kính hiển vi và đặc biệt kính hiển vi điện tử đã cho thấy sự khác biệt rất quan trọng giữa các tế bào đơn bào chưa hình thành rõ nhân (prokayote – chưa có nhân chính thức) và những sinh vật đơn bào hoặc đa bào đã có nhân chính thức (eukaryote). Herbert F. Copeland (1938) đã đề xuất phân chia sinh giới thành 4 giới: Monera, Protoctista, Plantae, Animalia. Ông đã tách hai nhóm sinh vật tiền nhân là vi khuẩn và vi khuẩn lam thành một giới riêng là giới Khởi Sinh Monera, những sinh vật đơn bào nhân chuẩn được xếp vào giới Nguyên Sinh Protista.
Những năm 1960, Stanier và Van Niel phân chia sinh giới thành 2 trên giới và sử dụng thuật ngữ Superkingdom hay Empire, nay nó còn được gọi là Domain. Trong đó, trên giới nhân sơ (Empire Prokaryota) gồm giới khởi sinh, trên giới nhân chuẩn (Empire Eukaryota) gồm giới Nguyên sinh, giới Thực vật và giới Động vật.
Robert H. Whittaker (1969)
Nhận thấy sự khác biệt giữa nấm và các thực vật khác trong giới thực vật. Ban đầu Haeckel đã tách nấm ra khỏi giới thực vật và gộp vào giới nguyên sinh, tuy nhiên quan điểm của ông sau nay có sự thay đổi. Robert H. Whittaker (1969) cũng nhận thấy sự khác biệt giữa nấm và các thực vật khác, ông đã tách nấm ra khỏi giới thực vật thành một giới nấm riêng biệt Fungi dựa trên cơ sở về mặt dinh dưỡng của nấm khác với động vật, thực vật. Giới Nấm gồm những nấm đa bào dị dưỡng theo kiểu hấp thụ trong khi đó giới Thực vật gồm sinh vật đa bào tự dưỡng, giới Động vật gồm sinh vật đa bào dị dưỡng theo kiểu nuốt.Whittaker (1969), đã chia sinh giới thành 5 giới sau: giới Khởi sinh (Monera), Nguyên sinh (Protista), Nấm (Fungi), Động vật (Animalia), Thực vật (Plantae).
R. H. Whittaker & Lynn Margulis (1978)
chia sinh giới thành 5 giới: Monera, Protoctista, Fungi, Plantae, Animalia. Trong giới Protoctista bao gồm cả những cơ thể đơn bào và đa bào, trong đó cơ thể đa bào có cấu trúc còn đơn giản, chưa có sự phân hóa mô phức tạp, đồng thời chia giới Nguyên sinh thành 3 phân giới sau: nấm nguyên sinh Myxobionta, động vật nguyên sinh Mastigobionta, thực vật nguyên sinh Phycobionta.
Armen Takhtajan
Chia sinh giới thành 4 giới gồm Monera, Fungi, Plantae, Animalia. Phủ nhận giới nguyên sinh, thực vật nguyên sinh, động vật nguyên sinh và nấm nguyên sinh được xếp vào 3 giới tương ứng và được gọi là thực vật bậc thập, động vật bậc thấp và nấm bậc thấp.
Carl Richard Woese (1977)
Chia sinh giới gồm 6 giới, 3 trên giới và dùng thuật ngữ Domain: Archaea ( trên giởi cổ sinh vật), Bacteria (trên giới sinh vật nhân sơ), Eukarya (trên giới sinh vật nhân chuẩn) dựa trên cơ sở phân tích rARN 16S. Kết quả phân tích Woese đã tách giới khởi sinh thành hai nhóm khác nhau gọi là Eubacteria và Archaeabacteria vì rARN của vi khuẩn và vi khuẩn cổ có sự khác nhau và thậm chí rARN của vi khuẩn cổ với sinh vật nhân chuẩn gần giống nhau hơn so với vi khuẩn. Trong hệ thống, trên giới nhân chuẩn bao gồm giới nguyên sinh, nấm, thực vật và động vật. Đến năm 1990, 2000 tác giả chỉ chia hệ thống sinh giới thành 3 trên giới.
Cavalier-Smith 2004
Trong tác phẩm “Only six kingdoms of life” chia sinh giới thành 2 trên giới với 6 giới. Ông không đồng ý với quan điểm của Woese (1977, 1990, 2000) là tách vi khuẩn và vi khuẩn cổ thành 2 trên giới. Ông chia sinh giới thành 2 trên giới nhân sơ (Prokaryota) và nhân chuẩn (Eukaryota). Trong trên giới nhân sơ gồm một giới Vi khuẩn (Bacteria), giới này bao gồm 2 phân giới: phân giới Negibacteria (Eobacteria, Sphingobacteria, Spirochaetae, Proteobacteria, Planctobacteria, Cyanobacteria) và phân giới Unibacteria (Posibacteria, Archaebacteria). Trên giới nhân chuẩn gồm 5 giới: Protozoa (động vật nguyên sinh), Chromista (thực vật nguyên sinh), Fungi, Plantae, Animalia.
Lynn Margulis và Micheal J. Chapman 2009
Với quan điểm chia sinh giới thành 5 giới, 2 trên giới (Superkingdom Prokarya và Superkingdom Eukarya).
Trên giới nhân sơ Prokarya gồm 1 giới Kingdom Prokaryotae (Bacteria, Monera, Prokarya) trong đó vi khuẩn và vi khuẩn cổ được chia thành 2 phân giới (Subkingdom (Domain) Archaea và Subkingdom (Domain) Eubacteria). Thuật ngữ Domain được hiểu là phân giới (Subkingdom).
Trên giới nhân chuẩn Eukarya được chia thành 4 giới: Protoctista, Fungi, Plantae, Animalia. Giới Protoctista bao gồm 7 phân giới với 32 ngành bao gồm sinh vật đơn bào và đa bào nhân chuẩn. Nguồn gốc của giới nấm xuất phát từ nấm cổ và Blastocladiomycota. Giới thực vật và ngành tảo lục có nguồn gốc chung là từ tảo Lục tổ tiên.