Elle est sous le vocable de Saint-Germain. En 1141, l’évêque Godefroi confirme l’abbaye de Moutiers-Saint-Jean en sa possession de l’église d’Aisy contre les prétentions de l’abbaye de Rougemont. L’évêque précise quand cas de nécessité on pourra baptiser les enfants dans l’église Sainte-Marie de Rougemont. L’église d’Aisy était autrefois une succursale de Rougemont.
Au XIIè siècle, l’église d’Aisy n’avait pas de fonds baptismaux et dépendait du prieuré d’Aisy, qui lui-même dépendait de Moutiers-Saint-Jean.
Le premier mars 1714 on commence la démolition de la nef de l’église qui est voûtée. Elle sera faite par Jean Lafage et Edme Flamant, tous deux tailleurs de pierre dans la paroisse. La nef sera reconstruite et elle sera bénie le 02 août 1716 par le curé du village, Jean-Claude Caillet, entouré de ses confrères des villages voisins.
Le 17 mai 1791 un arrêté ordonne au fermier du prieuré de continuer à verser la portion congrue au vicaire d’Aisy.
Dans le recensement de 1812, on ne trouve pas trace du presbytère mais dans les plans d’alignements de 1853 le presbytère est dans l’actuelle rue Marthe Saillard au n°20. C’est l’ancienne maison d’Alphonse Damoiseau, maire de la commune de 1816 à 1826. La maison sera vendue car il n’avait pas d’enfants (sa veuve meurt le 05 mai 1844). Des travaux y seront effectués en 1869.
En 1851 le cimetière est agrandi et on construit les murs de clôture.
En 1873-1874 les cloches de l’église seront refondues.
En 1930 on effectue des travaux sur le clocher de l’église.
Les vicaires et curés :
- 1624-1650 : ROUGET ou ROUGER
- 1652-1663 : MIAS François, né à Corrombles
- 1663-1667 : MARCOUX Rolland
- 1667-mai 1684 : SADON Jean, curé de Rougemont et Aisy signe les registres. Il est enterré dans l’église de Ravières.
- mai 1684-1686 : GAUDION Jean, puis curé de Stigny.
- 1686-juillet 1706 : COLLINOT Appollonius, prieur, signe les registres en l’absence de curé au village.
- juillet 1706-1739 : CAILLET Jean-Claude, curé de Rougemont et Aisy, né à Ravières et mort le 17 février 1739 à Rougemont.
- 1739-1742 : CAILLET Pierre, né à Ravières, il part ensuite à Chassagne.
- 1742 : CORMON-DUFERRIER Louis Joseph, né à Chaumont en 1705, mort le 14 février 1786 à Dancevoir (52) où il était prêtre.
- 1743-1756 : PIAUT Jean. Il a été précédemment prêtre à Annoux, ensuite il officie à Argenteuil jusqu’à la Révolution. Il meurt le 08 novembre 1792 à Argenteuil à 79 ans environ.
- 1756- février 1783 : ALEXANDRE Edme-Mammès, curé de Rougemont et Aisy, né le 15 novembre 1719 à Ancy-le-Franc. Il prête serment en 1791 et abdique en 1793. Mort le 20 Thermidor an 3 à Rougemont, toujours desservant d’Aisy.
- 1783-1787 : ACQUIN François-Noël, il partira à Fralinges (10), né le 25 décembre 1753, mort le 09 septembre 1829 à Bussières (52). Il quitte la prêtrise et se marie en 1802.
- 1787-1791 : MARCOUX Julien, né à Châtillon, il devient prêtre en 1777, il prête serment à la Révolution en 1791 mais abdiquera en 1794.
- 1791-1792 : GIBEY Edme, desservant d’Aisy, avant de Perrigny
- 1793-1795 : ALEXANDRE Edme Mammès, ci-dessus
- 1795-1805 : BLANCHOT Pierre René Nicolas, né au Mans
- 1805-1836 : ? Pas de curé dans les recensements de 1809 et 1836
- 1838-1852 : PENSÉE Jean-Clément, né en 1795 à Thol-les-Millières. Il devient prêtre après son veuvage. Il était auparavant instituteur. Il desserre ensuite Chevillon et meurt à St-Martin-sur-Armançon.
- 1853-1861 : MARQUOT Nicolas Polixène, né en 1827 à Celles (10)
- 1862-1873 : PLISSON Charles Nicolas Alexandre, né en 1805 à Abbeville (80)
- 1874-1888 : RENAUD Jean-Baptiste Louis César, né en 1835 à Germay (52)
- 1889-1891 : DIDIER Nicolas Adolphe, né vers 1836 à Metz (57)
- 1892 : PÉNARD Charles, né en 1860 à Sens
- 1893-1909 : MONTENAT François-Paul, né en 1861 à Vault-de-Lugny,
- 1909-1956 : GUILLAUMONT Pierre, né en 1879 à Saint-Just (63)