Les amebes, en fase de trofozoït, són organismes de morfologia variable que es desplacen mitjançant pseudopodis i s'alimenten per fagocitosis. La majoria de les espècies formen estructures de resistència denominades quists. Des d'un punt de vista filogenètic són un grup molt heterogeni, però d'una forma pràctica les amebes d'interès sanitari les podem agrupar de la manera següent:
Amebes paràsites d'animals domèstics i humans
Pertanyen a la Família Entamoebidae (Gèneres: Entamoeba, Endolimax, Iodamoeba)
La majoria de les espècies es localitzen a l'intestí gros. També hi ha amebes que viuen a la cavitat bucal dels seus hostes.
L'Entamoeba histolytica és l'espècie potencialment més patògena que sol afectar als humans.
Amebes de vida lliure que ocasionalment poden parasitar a persones i animals
Les infeccions són rares però poden causar problemes greus a humans i animals (per ex. la meningoencefalitis amebiana)
Les espècies implicades pertanyen als gèneres Acanthamoeba, Naegleria i Hartmannella
En les femtes d'animals domèstics és molt habitual observar amebes intestinals però no solen ser patògenes. En rèptils l'espècie E. invadens i en humans l' E. histolytica poden causar greus patologies intestinals i sistèmiques. L'espècie Malpighamoeba mellificae afecta a les abelles, causa inflamació i afectació de l'aparell digestiu.
Fam. Entamoebidae (Endolimax, Entamoeba, Iodamoeba)
Fam. Acanthamoebidae (Acanthamoeba)
Fam. Vahlkampfiidae (Naegleria)
Fam. Hartmannellidae (Hartmannella)