1928年（昭和3）、うら若き考古学徒・樋口清之は学部の学生の身分でありながら、中学時代に奈良県各地で収集した考古コレクション約3,000点を本学に寄贈、それをもとに「考古学標本室」が創設されました。

遡ること1904年（明治37）、最初の学術展覧会として東京帝国大学人類学標本展覧会を開催した坪井正五郎（東京帝国大学教授／國學院大學講師）、そして彼に師事する鳥居龍蔵（東京帝国大学助教授／國學院大學教授）は、近代人類学・考古学で種々の業績を遺しただけではなく、近代博物館学の暁を告げる学者の一人としてその名を連ねました。

この鳥居龍蔵を師と仰ぐ樋口清之による考古学標本室改め、考古学資料室（1932年）の形成、そしてその本格的な大学博物館としての拡充によって、國學院大學の博物館学は少しずつ萌芽の兆しをみせてきました。

さらに樋口清之は学生として勉学に勤しむ傍ら、近代博物館学の礎を築いた棚橋源太郎（東京教育博物館・東京博物館館長／ICOM名誉会員）にも学ぶことでその学識を深めました。

やがては、本学に着任して25年後、博物館法が制定される6年後の1957年に國學院大學博物館学講座を開講しました。

このようにして、國學院大學における博物館学は、1952年には博物館法に定める博物館相当施設の指定を受けた最初の大学博物館のひとつとなった考古学資料室を附属施設として、国家資格としての学芸員の養成の一翼を担うとともに本格的にその幕を開けました。

樋口清之は、考古学者として1947年の静岡県登呂遺跡発掘調査にはじまる戦後考古学の黎明を支えたのみならず、加藤有次とともに長らく博物館学講座を担当し、後進の育成にあたりました。

また、樋口清之、加藤有次はともに本学を拠点として、1957年には博物館学講座を開講する大学間の連絡組織として「全国大学博物館学講座協議会」、1973年には博物館をフィールドとした研究を対象とした学術的な研究組織として「全日本博物館学会」の創設に携わり、戦後博物館学のインフラストラクチャー整備にも寄与してきました。

この間、学芸員資格取得者のみならず、全国の博物館や美術館で活躍する学芸員、大学で学芸員の養成を担う研究者を本学から数多く送り出してゆきました。

なお、博物館学講座の開講以来、研究活動や博物館実習を中心とした教育活動の舞台ともなった考古学資料室は、1975年に考古学資料館へと発展拡大し、半世紀にわたって本学における博物館学の発展を支えていきました。

やがては、神道学資料室（1963年）を母体とする神道資料館（1990年）と統合、新たに学術資料館として改組されて現在の國學院大學博物館（2007年）へと連なり、2018年（平成30）には開館90年を迎えました。