El nombre Ibea de Juarros proviene del vasco "ibea" o "ibeia" que se refiere a un lugar junto al río, y "juarros" o "zubarro" o "zugarro", que significa olmo.
Los orígenes de Ibeas de Juarros están relacionados con la conquista y repoblación por los cristianos del Norte, que vinieron de Covadonga por el año 720 y en el camino lucharon contra los árabes llegando al final a estas tierras entre los años 800 y 900. A partir de esos años este terreno se fue llenando de gente. Una razón importante por la que creció la población, es que Ibeas fue un lugar donde se cruzaban varios caminos. Por ahí pasaban tres caminos muy importantes: el Camino Viejo Real, el Camino Real Francés y el Camino Real de la Lana. El primero se considera el camino original de Camino de Santiago, y durante la Edad Media, el Camino de Santiago pasaba por este pueblo.
La Sierra de Atapuerca es un conjunto montañoso que está al norte de Ibeas de Juarros y desde el año 2000 está considerada como Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO gracias a los hallazgos arqueológicos y paleontológicos que allí tuvieron lugar. Este lugar es el yacimiento arqueológico más importante de Europa, porque allí se encuentran muchos restos humanos y gracias a ellos la gente puede entender mejor quiénes son y de donde vienen. Por ejemplo, en el año 1976 un grupo de arqueólogos encontró el primer fósil humano en una cueva de Atapuerca, conocida como la Sima de los Huesos y hasta el año 1984 los arqueólogos hicieron excavaciones regularmente para descubrir la evolución humana en detalle.
En la Sima de los Huesos se descubrió un cráneo, conocido como cráneo 17, con dos perforaciones en la frente que indica que fue un asesinato. Se trata del primer asesinato conocido de la historia cometido hace 436.000 años. El cráneo es uno de los cráneos humanos mas completos y ha sido reconstruido con los 52 fragmentos recuperados a lo largo de los últimos 20 años.