ワイヤーフレーム表示で手前側のスムーズメッシュオブジェクトを選んだ場合も奥側のオブジェクトが追加選択されてしまいます。
Extension 2 for Autodesk Maya 2013、Extension for Autodesk Maya 2014 Service Pack 2 で(レンダラは既存精度のレンダリング)この現象がありました。
3個以上のオブジェクト複数選択の場合はこのMELは対応しておりません。
//奥側のオブジェクトを選択したい場合
string $objects[]= `ls -sl`;
$mm=`size($objects)`;
select -r $objects[($mm)-2]
★補足
//手前側のオブジェクトを選択したい場合
string $objects[]= `ls -sl`;
$mm=`size($objects)`;
select -r $objects[($mm)-1]