Komplex III (cytochróm c reduktáza, ubichinón-cytochróm c oxidoreduktáza) je tretím komplexom terminálnej oxidácie.
Ubichinón, ktorý prináša elektróny z komplexu I alebo komplexu II ich odovzdáva komplexu III, ktorý sa skladá z viacerých cytochrómov (cytochróm c1, cytochróm bH, cytochróm bL). Detaily prenosu elektrónov sú vo videu nižšie. Elektróny sa nakoniec prenášajú z komplexu III na cytochróm c, ktorý sa nachádza na vonkajšej strany vnútornej mitochondriálnej membrány, je mobilný a naraz prenáša len jediný elektrón na komplex IV.
Počas tohto procesu dochádza k presunutiu cca. 4 protónov cez vnútornú mitochondriálnu membránu do medzimembránového priestoru, vďaka čomu komplex III prispieva k vytváraniu protónového gradientu na vnútornej mitochondriálnej membráne.