Komplex II (sukcinátdehydrogenáza) je druhým komplexom terminálnej oxidácie. Zároveň plní svoju úlohu ako jeden z enzýmov Krebsovho cyklu.
Dochádza na ňom k odoberaniu 2 elektrónov zo sukcinátu, ktorý sa mení na fumarát, elektróny a protóny prijíma koenzým FAD. Elektróny sú následne presúvané z FAD cez Fe-S centrá na koenzým Q10 (ubichinón).
Počas tohto procesu nedochádza k presúvaniu protónov cez vnútornú mitochondriálnu membránu do medzimembránového priestoru, teda komplex II neprispieva k vytváraniu protónového gradientu. Redukovaný ubichinón prenáša 2 elektróny a 2 protóny na komplex III.