Autel de Saint-Luc, connu sous le nom d'autel Bandinelli parce qu'il a été confié au patronage de cette famille. Sur l'autel se trouve le tableau de Girolamo del Pacchia représentant la Vierge trônant avec l'Enfant Jésus, saint Luc et saint Benoît vêtus à la manière des Olivétains. Il est attribué à Girolamo del Pacchia et a été peint au XVIe siècle, après la décoration de l'Oratoire de San Bernardino avec des artistes comme Sodoma et Beccafumi, dont il est proche par le style, dans le sillage de la fascination de Raphaël pour les nouveautés stylistiques à Rome. Le précieux retable est encadré par un autel baroque qui reflète celui du crucifix placé devant lui.
À droite de l'autel de Saint-Luc se trouve une plaque, la plus ancienne de l'église, sur laquelle on peut lire : "+ NOBILIS PUER ATQUE TENELLUS JACET HIC BANDINELLUS JUBENTE DOMINO IOANNE AVO ANNO MCCL OCTAVO" ou "Ici repose Bandinello, noble et tendre enfant par la volonté de son grand-père, le signor Giovanni anno 1250, la huitième année de sa vie".