O Conselho Nacional da UNE é o principal fórum deliberativo do movimento estudantil brasileiro. Realizado a cada dois anos, é o momento em que estudantes de todas as regiões do país, eleitos delegados em suas universidades, elegem a nova diretoria e presidência da UNE. Todo estudante pode participar.
O Conselho Nacional das Entidades Gerais é organizado anualmente pela UNE. Reúne representantes de DCEs, UEEs, federações e executivas de cursos de todo o Brasil. Normalmente, o CONEG é realizado para convocar atividades da UNE, como o Congresso e a Bienal, e aprovar pauta específica, como a plataforma política que os estudantes apresentam a cada eleição. Todo estudante pode participar.
O Conselho Nacional de Entidades de Base é um fórum deliberativo organizado a cada dois anos pela UNE. O objetivo é reunir os representantes dos Diretórios e Centros Acadêmicos de todo o Brasil para atualizar pautas, discutir e aprovar resoluções e ações do movimento estudantil. Todo estudante pode participar.
Outros espaços da UNE:
A Bienal de arte, cultura, esporte, ciência e tecnologia é realizada no verão dos anos ímpares e reúne as diversas expressões artísticas estudantis, valoriza a identidade nacional e conecta as produções culturais juvenis de todas as regiões em um grande encontro, considerado hoje o maior festival estudantil da América Latina.
O Circuito Universitário de Cultura e Arte promove diversas linguagens artísticas como música, literatura, cinema, dança e teatro, além do intercâmbio com as manifestações populares e urbanas. O CUCA também pode atuar na perspectiva da extensão universitária em ações com a comunidade as Vidmate app.
O Encontro de Mulheres Estudantes da UNE surgiu em 2005, por iniciativa da Diretoria de Mulheres da UNE, com o objetivo de ser um espaço de organização e fortalecimento do debate feminista na entidade, contribuindo para o combate ao machismo e a toda opressão sofrida dentro das universidades e no movimento estudantil.
O Encontro de Estudantes Negras, Negros e Cotistas da UNE é um espaço privilegiado de debate e convergência sobre os impactos da adoção de políticas de ações afirmativas para a população afrodescendente no ensino superior brasileiro. Acontece em encontros que discutem em mesas, palestras, oficinas e atividades culturais temas como a reserva de vagas, cotas, permanência e descolonização do conhecimento.