2011
第34回日本分子生物学会年会｜Dec. 13-16, 2011｜パシフィコ横浜，横浜市，神奈川県
珪藻細胞中の窒素固定に特化したオルガネラ「楕円体」：オルガネラ獲得過程理解にむけた新たなモデル
Nitrogen-fixing organelles, spheroid bodies, in rhopalodiacean diatom cells as an evolutionary model for understanding organelle acquisition. （Oral, Invited t シンポジウム2S3-I "Diversity and molecular evolution of mitochondria, plastids, and related organelles."）
稲垣祐司，中山卓郎，笠井文絵，大河内直彦．
第31回微生物系統分類研究会｜Nov. 25, 2011｜理化学研究所，和光市，埼玉県
新奇真核微生物からの大規模配列データで変貌し続ける、我々の真核生物大系統像／Phylogenomic data from novel eukaryotic microbes can trigger drastic changes on our view on the global eukaryotic phylogeny. （Oral, Invited）
稲垣祐司，矢吹彬憲，神川龍馬．
第11回放散虫研究集会｜Oct. 29-30, 2011｜愛媛大学，松山市，愛媛県
複数遺伝子解析により明らかとなった放散虫と有孔虫の姉妹関係 （Oral）
石谷佳之，石川奏太，稲垣祐司，土屋正史，瀧下清貴．
IUMS2011 (International Union of Microbiological Societies 2011 Congress)｜Sep. 6-10, 2011｜Sapporo Convention Center, Sapporo, Hokkaido
Tsukubamonas globosa is a deep-branching member in the Discoba clade: Morphology, phylogenomics, and mitochondrial genome. （Oral, Invited）
Akinori Yabuki, Ryoma Kamikawa, Martin Kolisko, Sohta A. Ishikawa, Ken-ichiro Ishida, Alastair G. B. Simpson, Andrew J. Roger, Yuji Inagaki
Trans-splicing of split introns is required for the expressions of indispensable genes in Giardia intestinalis. （Oral, Invited）
Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto
Aug 6 Dalhousie University, Halifax, Canada
CGEB (Center for Comparative Genomics and Evolutionary Bioinformatics) meeting
Recent progress in placing newly-discovered lineages of protists in the deep tree of eukaryotes. （Oral, Invited）
Yuji Inagaki.
SMBE2011｜Jul. 26-30, 2011｜Kyoto University, Kyoto, Kyoto
Spliceosomal introns in a split form: Another aspect of intron evolution in eukaryotes. （Poster）
Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Andrew J. Roger, Tetsuo Hashimoto.
Molecular evidence for the residual nuclear genome of the green algal endosymbiont in the dinoflagellate Lepidodinium chlorophorum. （Poster）
Takuya Matsumoto, Ryoma Kamikawa, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki.
The phylogenetic position of the katablepharid Leucocryptos marina based on seven mitochondrial gene sequences. （Poster）
Yuki Nishimura, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto.
Difference in transcriptional regulation between two genes encoding plastid-targeted GAPDH in the dinoflagellate Karenia mikimotoi. （Poster）
Yuki Yazaki*, Ryoma Kamikawa, Takuya Matsumoto, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki.
【*One of the ten winners of Undergraduate Mentoring and Diversity Program Award】
Intragenomic gene conversion in the evolution of bacterial peptide-chain release factors. （Poster）
Sohta Ishikawa, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki
Effective bootstrapping: A new method for estimating accurate credibilities of splits on a phylogenetic tree. （Poster）
Akifumi S Tanabe, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto, Miwako Tsuji, Mitsuhisa Sato.
Molecular phylogeny of the amitochondriate lineage, Fornicata, based on multi-gene analysis. （Poster）
Hiroshi Komatsuzaki, Kiyotaka Takishita, Martin Kolisko, Akinori Yabuki, Andrew J. Roger, Alastair G.B. Simpson, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto.
第5回日本進化原生生物学研究会｜Jun. 11-12, 2011｜富山大学，富山市，富山県
渦鞭毛藻Lepidodinium「葉緑体型」GAPDH遺伝子の転写活性比較 （Oral）
矢崎裕規，神川龍馬，松本拓也，橋本哲男，稲垣祐司．
ミトコンドリア7遺伝子に基づくカタブレファリス類Leucocryptos marinaの系統的位置 （Oral）
西村祐貴，神川龍馬，稲垣祐司，橋本哲男．
159遺伝子データに基づく従属栄養性真核微生物Palpitomonas bilixの系統的位置 （Oral）
矢吹彬憲*，神川龍馬*，Martin Kolisko，石田健一郎，田辺晶史，橋本哲男，稲垣祐司．【*equally contributed】
Tsukubamonas globosaのPhylogenomic解析と部分的ミトコンドリアゲノム配列 （Poster）
神川龍馬*，矢吹彬憲*，Martin Kolisko，西村祐貴，石川奏太，石田健一郎，橋本哲男，Andrew J Roger，Alastair GB Simpson，稲垣祐司．【*equally contributed】
複数遺伝子解析により得られた放散虫と有孔虫の姉妹関係 （Oral）
石谷佳之，石川奏太，稲垣祐司，土屋正史，瀧下清貴．
寄生性真核微生物Giardiaの縮退ゲノムにおける複雑な遺伝子発現 （Oral） 【Best Presentation Award】
神川龍馬，稲垣祐司，Andrew J Roger，橋本哲男．
真核生物における翻訳伸長因子EF-1alphaおよび翻訳伸長因子様タンパク質EFLの進化 （Poster）
神川龍馬，稲垣祐司．
緑色渦鞭毛藻類Lepidodinium chlorophorumが持つ共生体退化核遺伝子について （Oral）
松本拓也，神川龍馬，橋本哲男，稲垣祐司．
ミトコンドリアをもたないプロティスト分類群'Fornicata'の分子系統：複数遺伝子に基づく解析 （Poster）
小松崎洋志，瀧下清貴，Marin Kolisko，矢吹彬憲，雪吹直史，稲垣祐司，橋本哲男，Andrew J Roger，Alastair GB Simpson．
Red vs. Green: Apicomplexa類における退化型葉緑体apicoplastの起源に関する分子系統学的研究 （Oral）
石川奏太，稲垣祐司，橋本哲男．
日本地球惑星科学連合 2011年大会｜May 22-27, 2011｜幕張メッセ国際会議場，千葉市，千葉県
真核生物ゲノムの可塑性：渦鞭毛藻類葉緑体関連遺伝子の起源を例に／Plasticity of eukaryotic genomes: The proteomes of dinoflagellate plastids as a case study.（Oral）
稲垣祐司．
Rhopalodia科珪藻に見られる細胞内共生シアノバクテリアの起源と分子進化 （Poster）
中山卓郎，池上裕子，中山剛，井上勲，稲垣祐司，笠井文絵．
第35回日本藻類学会｜Mar, 27-28, 2011｜富山大学，富山市，富山県
所属不明の原生生物Palpitomonas bilixの系統的位置の解明 （Oral）
矢吹彬憲，神川龍馬，Martin Kolisko，田辺晶史，Andrew J. Roger，橋本哲男，石田健一郎，稲垣祐司．
オミクス情報に基づく藻類・プロティスト複合系の多様性解明へのアプローチ （Poster）
横山亜紀子，守屋繁春，菊池淳，兪 一雯，Craig Evarroad，Diogo Ogawa，皿井千裕，稲垣祐司，中山剛，石田健一郎，橋本哲男，渡辺信，井上勲．
平成23年度日本水産学会春季大会｜Mar, 27-31, 2011｜東京海洋大学，港区，東京都
赤潮原因ラフィド藻類におけるミトコンドリアゲノムの全塩基配列 （Oral）
神川龍馬，増田功，上田学，大山憲一，吉松定昭，稲垣祐司，左子芳彦．
真核生物における翻訳伸長因子遺伝子の多様性 （Poster）
神川龍馬，橋本哲男，稲垣祐司．
日本生態学会第58回札幌大会｜Mar, 8-12, 2011｜札幌コンベンションセンター，札幌市，北海道
最尤系統樹の信頼性指標に対するバイアスの定量化 （Poster）
田辺晶史，稲垣祐司，橋本哲男，辻美和子，佐藤三久．
NBRP「藻類」シンポジウム『未来を支える藻類，その多様性―ゲノミクス・ポストゲノミクスの視点から』｜Jan. 29, 2011｜新宿住友ビル，新宿区，東京都
無色系統群の研究から炙り出される真核藻類の進化―ゲノミクスの視点を含めて （Oral, Invited）
稲垣祐司，矢吹彬憲，神川龍馬，西村祐貴，石田健一郎，橋本哲男．