Jabatan Patologi merupakan salah satu Jabatan dalam direktorat diagnostik klinikal dan berperanan dalam memberikan perkhidmatan makmal diagnostik dan konsultasi kepada Hospital Melaka, Hospital Daerah Negeri Melaka, Klinik-klinik Kesihatan Negeri Melaka dan beberapa hospital kerajaan di negeri berhampiran.
Jabatan Patologi terdiri daripada unit unit berikut:
a) Pengurusan Patologi
b) Kaunter Utama
c) Patologi Kimia
d) Patologi Anatomik
e) Hematologi
f) Mikrobiologi Perubatan