Năm 1 và đầu năm 2 (học kỳ 1-3) : giai đoạn đại cương.
Từ cuối năm 2 (học kỳ 4-8): giai đoạn chuyên ngành
Học kỳ 4: Quy hoạch tuyến tính, Thuật toán tối ưu, Kinh tế lượng.
Học kỳ 5: Vận trù học, Lý thuyết quy hoạch phi tuyến, Mô hình toán kinh tế, Quy hoạch tuyến tính nâng cao.
Học kỳ 6: Tối ưu hoá ứng dụng, Tối ưu nhiều mục tiêu, Lý thuyết và thuật toán tối ưu không trơn, Cơ sở giải tích lồi và quy hoạch lồi.
Học kỳ 7: Quản trị doanh nghiệp, Điều khiển tối ưu, Lý thuyết trò chơi, Seminar Toán Kinh Tế.
Học kỳ 8: Thực hiện tiểu luận tốt nghiệp (hoặc học 1 số môn khác).
Lưu ý: Gợi ý trên chỉ mang tính tham khảo và có thể thay đổi, sinh viên nên liên hệ với cán bộ phụ trách bộ môn để được tư vấn và hướng dẫn trước mỗi học kỳ.
Cấu trúc liên kết học phần chuyên ngành Tối ưu và Hệ thống (xem tại đây).