Commentaires
Les groupes classiques semblent bien tous monophylétiques, mais il y a encore beaucoup d'incertitude sur leurs relations. On ne peut guère proposer mieux que cet arbre.
Acariens - Il devient assez fortement probable que les Acariens ne soient pas monophylétiques, car les deux clades qui composent ce groupe (Acariformes et Parasitiformes) ne seraient pas groupes frères (sans que le positionnement de ces clades dans la phylogénie des Arachnides soit clair). Nous restons prudent sur ce point pour le moment, mais notre arbre va probablement bientôt intégrer ces nouveaux résultats.
Pseudoscorpions - Les derniers résultats publiés semblent montrer assez fortement que les Pseudoscorpions seraient le groupe frère des Scorpions (et donc inclus dans les Arachnopulmonés). Le clade (Pseudoscorpions, Scorpions) serait appelé Panscorpions. Nous restons prudent sur ce point pour le moment.
Xiphosures - Les études récentes montrent majoritairement (mais pas toutes) que les Xiphosures ne seraient pas le groupe frère des Arachnides, mais se placeraient au sein des Arachnides (sans ce que placement soit clair). Les Arachnides constitueraient donc un groupe paraphylétique. Le terme Arachnides est cependant conservé, mais inclurait désormais les Xiphosures et devrait être pris comme synonyme de Euchélicérates (par ailleurs aussi synonyme de l'ancien terme Chélicérates, i.e. tous les Arthropodes à chélicères sauf les Pycnogonides).
Références
Ballesteros JA & Sharma PP (2019) A critical appraisal of the placement of Xiphosura (Chelicerata) with account of known sources of phylogenetic error. Systematic Biology, 68: 896-917
Ballesteros JA, Santibáñez López CE, Kováč L, Gavish-Regev E & Sharma PP (2019) Ordered phylogenomic subsampling enables diagnosis of systematic errors in the placement of the enigmatic arachnid order Palpigradi, Proceedings of the Royal Society B, 286: 20192426
Ban XC, Shao ZK, Wu LJ, Sun JT & Xue XF (2022) Highly diversified mitochondrial genomes provide new evidence for interordinal relationships in the Arachnida. Cladistics, doi: 10.1111/cla.12504
Edgecombe GD & Legg DA (2014) Origins and early evolution of Arthropods. Frontiers in Palaeontology, 57: 457-468
Giribet G & Edgecombe GD (2012) Reevaluating the Arthropod tree of life. Annual Reviews of Entomology, 54: 167-186
Giribet G (2018) Current views on chelicerate phylogeny - A tribute to Peter Weygoldt. Zoologischer Anzeiger, 273: 7-13
Giribet G & Edgecombe GD (2019) The phylogeny and evolutionary history of Arthropods. Current Biology, 29: R592-R602
Howard RJ, Puttick MN, Edgecombe GD & Lozano-Fernandez J (2020) Arachnid monophyly: Morphological, palaeontological and molecular support for a single terrestrialization with Chelicerata. Arthropod Structure & Development, 59: 100997
Lozano-Fernandez J, Tanner AR, Giacomelli M, Carton R, Vinther J, Edgecombe GD & Pisani D (2019) Increasing species sampling in chelicerate genomic-scale datasets provides support for monophyly of Acari and Arachnida. Nature Communications, 10: 2295
Ontano AZ, Gainett G, Aharon S, Ballesteros JA, Benavides LR, Corbett KF, Gavish-Regev E, Harvey MS, Monsma S, Santibáñez-López CE et al. (2021) Taxonomic sampling and rare genomic changes overcome long-branch attraction in the phylogenetic placement of Pseudoscorpions. Molecular Biology and Evolution, 38: 2446-2467
Ontano AZ, Steiner HG & Sharma PP (2022) How many long branch orders occur in Chelicerata? Opposing effects of Palpigradi and Opilioacariformes on phylogenetic stability. Molecular Phylogenetics and Evolution, 168: 107378
Noah KE, Hao J, Li L, Sun X, Foley B, Yang Q & Xia X (2020) Major revisions in Arthropod phylogeny through improved supermatrix, with support for two possible waves of land invasion by Chelicerates. Evolutionary Bioinformatics, 16: 12-12
Roeding F, Borner J, Kube M, Klages S, Reinhardt R & Burmester T (2009) A 454 sequencing approach for large scale phylogenomic analysis of the common emperor scorpion (Pandinus imperator). Molecular Phylogenetics and Evolution, 53: 826-834
Sharma PP, Kaluziak ST, Pérez-Porro AR, González VL, Hormiga G, Wheeler WC & Giribet G (2014) Phylogenomic interrogation of Arachnida reveals systemic conflicts in phylogenetic signal. Molecular Biology and Evolution, 31: 2963-2984
Sharma PP, Ballesteros JA & Santibáñez-López CA (2021) What is an "Arachnid"? Consensus, consilience, and confirmation bias in the phylogenetics of Chelicerata. Diversity, 13: 568