On va prendre les données suivantes d'expression: données 1
faire les analyses statistiques qui vous semblent pertinentes !
De meme avec les données de Stage proposées par Marine Punkow: données 2 et données 3
Pour faire l'analyse de la variance, on pourra suivre la methode (exposée ici) suivante:
toto=file.choose() % pour connaitre l'emplacement du fichier de donnees (en CVS par exemple)
clones=read.csv(file=toto,head=T,sep=",") % lit les donnees
r = c(t(as.matrix(clones))) % concatène les colonnes
f = c("AntibioLevel1", "AntibioLevel2", "AntibioLevel3", "AntibioLevel4") % donnes les valeurs du facteur niveau d'antibio
k = 4 % nombre de niveaux
n = 4 % nombre d'observations par niveau
factorvector = gl(k, 1, n*k, factor(f)) % construit le vecteur de facteurs
av = aov(r ~ tm) % on effectue l'ANOVA
summary(av) % on analyse les résultats la proba P(>F) donne la p-value qui permet de decider du resultat
Pour faire le test de Kruskal-Wallis, on pourra juste faire
kw = krukal.test(r,factorvector)
kw
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