T6. Taxonomy Browser

Filogenia

https://www.nature.com/scitable/topicpage/reading-a-phylogenetic-tree-the-meaning-of-41956/


Taxonomía para

1. Buscar Especies, Taxonomy Browser (ver abajo)

2. Proteínas relacionadas http://www.treefam.org

3. Arboles ya hechos http://tolweb.org/tree/

4. Arbol de la Vida http://itol.embl.de/itol.cgi

El Taxonomy Browser es muy útil para encontrar toda la información que ha sido publicada con respecto a una especie concreta.

Paso 1. Click en el link http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/?term=

Paso 2. Ingrese el nombre de una especie, Arabidopsis thaliana

Paso 3. Observe en el lateral derecho la información

  • Si damos click en el Genoma, notaremos el detalle de los cromosomas. Note que además de los 5 cromosomas hay un MT y un Pltd... Qué son?

  • Si damos click en nucleotide veremos las secuencias de ADN publicadas (Estas secuencias no necesariamente son genes)

    • Note que las secuencias Nucleotide EST son muchas.... Por qué?

    • Note que Gene tiene alrededor de 30mil accesiones, pero Protein tiene 229mil... Por que?