Este subprojeto tem o objetivo de identificar as espécies de aves e mamíferos presentes nos fragmentos florestais do CEP. A relevância desse levantamento reside em dois fatos: a conhecida existência de espécies endêmicas nesse bioma e a escassez de informações sobre elas.

Aves:

Para elaboração dos inventários as aves serão amostradas através das listas "n espécies", mais conhecidas no Brasil por "listas de MacKinnon" (MacKinnon e Phillips 1993). Trata-se de uma metodologia na qual o esforço amostral baseia-se em número de observações, na qual o observador segue por uma transecção e anota as espécies vistas e/ou ouvidas em sequência até o número de 10 espécies, que não deve conter espécies repetidas. Depois de terminada essa lista, inicia-se uma nova, na qual podem entrar espécies que foram registradas anteriormente, contanto que não sejam os mesmos indivíduos registrados.

Para a caracterização qualitativa e quantitativa da comunidade de aves, a combinação das listas "n espécies" com a estimação estatística da riqueza é mais padronizável que qualquer outra metodologia (Herzog et al. 2002). Assim, os ornitólogos irão aplicar esta metodologia em cada um dos fragmentos durante 3 dias consecutivos, iniciando as observações pelas manhãs. O estimador não paramétrico Chao1 será utilizado com as listas durante todos os dias de campo. O número de espécies observado, quando atingir 90% daquele estimado por Chao1 (Herzog et al. 2002), indica que a maioria das espécies de uma área já foi registrada e, a partir daí, poucas espécies novas serão acrescentadas à listagem mesmo com o aumento expressivo do esforço amostral.

As aves serão registradas com o auxílio de binóculos e as vocalizações serão gravadas com gravadores digitais e microfones direcionais para depósito no arquivo de vocalizações de espécies neotropicais da Seção de Aves do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP) e na Fonoteca Jacques Vielliard (UNICAMP), sendo imediatamente disponibilizadas para a comunidade científica. 

Além disso, em cada fragmento as amostragens serão complementadas com o uso de redes de neblina, que permitirão também a coleta de material para análises genéticas e para a análises morfológicas mais detalhadas dos espécimes. As aves serão capturadas com redes de neblina de nylon com medidas de 12 X 2,5 m, malha 1-1/4’’, instalando 20 redes em cada fragmento durante uma semana, dispostas em série em corredores pré-definidos nos quais o mínimo possível de vegetação (galhos) será removido para a instalação, em duas estações do ano (seca e chuvosa). As redes serão monitoradas a cada 20 minutos e as aves capturadas ficarão retidas em sacos de pano de tecido poroso para serem medidas e anilhadas. Para extração de DNA, uma gota de sangue será retirada de cada ave, através de um pequeno corte na ponta de uma das unhas e retirada com uma micropipeta (Francisco et al. 2007). Após este procedimento, a unha de cada ave será limpa com etanol 70% e uma solução hemostática líquida será aplicada no local para estancar o sangramento.

Posteriormente, cada ave receberá uma anilha de alumínio do CEMAVE, com uma numeração única, além de uma combinação de uma a três anilhas coloridas que permitirão a identificação individual por observação direta. Após receberem anilhas para identificação permanente, os animais serão soltos sem sofrerem danos. 

Responsáveis: Luís Fábio Silveira e Mercival Francisco.

Mamíferos de médio e grande porte:

Em cada fragmento, oito câmeras automáticas serão instaladas por 30 dias, padronizando um esforço amostral de 240 armadilhas fotográficas/dia (Beca et. al 2017). As armadilhas serão espacialmente distribuídas de forma a tentar amostrar a maior área possível de cada fragmento e manter independência amostral entre os pontos. Cada câmera será instalada em um troco de árvore com diâmetro mínimo de 15 cm a altura do peito e a 45 cm do chão (Srbek-Araujo and Chiarello, 2005). Adicionalmente, com o objetivo de obter uma maior quantificação da riqueza de espécies, técnicas indiretas de amostragem também serão realizadas, a partir da identificação de vestígios, como fezes, pegadas, carcaças e pelos. 

A quantificação da riqueza de espécies será definida pelo número total de espécies encontradas em cada fragmento. Para saber se a amostragem realizada foi suficiente, curvas de acumulação serão geradas, baseadas no número de dias amostrados pelo número de espécies encontrados por paisagem (Gotelli and Cowell, 2001). Modelos lineares gerais (GLM) serão feitos para avaliar o efeito das métricas de paisagens (tamanho do fragmento, conectividade, quantidade de borda) na riqueza de espécies de cada fragmento e índices de dissimilaridade serão gerados a fim de comparar as comunidades de cada paisagem (Beca et. al 2017). 

Para avaliar o nível de ocorrência serão realizadas análises a partir de modelos de ocupação (Mackenzie et.al, 2002 e 2006), que avaliam a probabilidade de determinada espécie ocupar e ser detectada em determinado local. Os modelos serão gerados por um programa que testa aleatoriamente os padrões de ocorrência de todas as espécies encontradas nas armadilhas em cada um dos fragmentos através de uma matriz de presença-ausência.

Responsáveis: Ana Paula Carmignotto, Mauro Galetti e Pedro Galetti.

Pequenos mamíferos não-voadores: 

Em cada fragmento os pequenos mamíferos não voadores (roedores e marsupiais) serão amostrados pela metodologia de captura-marcação-recaptura (Petersen 1986) utilizando armadilhas de gaiola tipo Tomahawk e Sherman e armadilhas de queda do tipo balde (pitfall). As armadilhas do tipo Tomahawk utilizadas na amostragem possuem tamanho (22x22x45cm) e as armadilhas Sherman possuem dois tamanhos, (7x9x27cm) e (12x14x33cm), destinadas portanto a diferentes tamanhos de mamíferos. Os baldes utilizados nas armadilhas pitfall serão de 60 litros, evitando que o animal consiga saltar para fora do balde, uma vez capturado. Os baldes serão enterrados linearmente ao nível do solo e conectados por uma cerca guia com 1 m de altura e base enterrada no solo. Serão instaladas três linhas de baldes, com cada linha composta por seis baldes distantes 10 metros entre si. 

As armadilhas Tomahawk e Sherman serão dispostas na transecção, contendo no mínimo 80 estações de captura, distantes aproximadamente 10 metros uma da outra. Cada estação será composta por duas armadilhas, uma Tomahawk e uma Sherman, sendo uma instalada no nível do solo e outra em cipós ou ramos de árvores entre 0,5 e 1,5 metro acima do solo. As armadilhas serão iscadas com uma massa feita a partir da mistura de banana madura, paçoca, sardinha e fubá. As armadilhas permanecerão armadas por cinco dias e serão vistoriadas nas primeiras horas do dia todas as manhãs durante todo o período de captura. Com este desenho amostral teremos um esforço diário de 160 gaiolas e 18 pitfalls por noite, num total de 800 gaiolas e 90 pitfalls por fragmento em cada campanha, que permite amostrar mais de 80% da comunidade local (Thompson et al. 2007).

Para aumentar a eficiência da amostragem, a transecção será percorrida no período noturno em busca de espécies arborícolas e elusivas que não são capturadas pela metodologia de gaiolas e baldes. Com auxilio de lanterna será usado o facheio de luz em busca de indivíduos na copa das árvores e, quando possível, será feita a coleta destes indivíduos por um especialista.Todos os protocolos serão guiados e executados de acordo com a normativa do American Society of Mammalogists (Sikes 2016).

Todos os indivíduos capturados durante o trabalho serão identificados com auxílio de bibliografia especializada e junto às coleções do Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo (MZUSP). Para cada indivíduo capturado será registrado a localidade (fragmento e coordenada geográfica da estação de coleta), tipo de armadilha e a altura da armadilha (solo ou sub-bosque). Os roedores e marsupiais capturados serão marcados com brincos de identificação (eartags), mensurados e posteriormente soltos no mesmo lugar da captura.

Responsáveis: Ana Paula Carmignotto, Mauro Galetti e Pedro Galetti.​

Morcegos:

Também será realizada em cada fragmento a amostragem de mamíferos voadores, utilizando para isso a captura através de redes de neblina: deverão ser instaladas, em cada campanha, cinco redes de neblina (12 x 2,5 m) em cada um dos fragmentos estudados e em locais definidos em campo como os mais apropriados para a captura de morcegos. As capturas com redes de neblina deverão ser realizadas por duas noites consecutivas em cada fragmento, sempre no período entre o final da lua minguante e o final da lua nova, e permanecerão abertas durante seis horas a partir do entardecer e verificadas em intervalos de, no máximo, 30 minutos. 

Para aumentar a eficiência da amostragem, serão feitas buscas ativas em todas as áreas onde existirem construções abandonadas ou mesmo em uso, e conhecidas por abrigarem morcegos (no forro, principalmente). Cavidades e ocos também deverão ser investigados. Caso sejam encontrados espécimes durante a busca ativa, ou ocasionalmente durante o deslocamento entre os fragmentos, esses serão coletados manualmente com auxílio de puçá ou luva de couro e serão acondicionados em sacos de pano com identificação dos dados de origem (local, data e método de coleta).​ 

A marcação dos morcegos para posterior liberação deverá ser realizada com colares plásticos com cilindros coloridos, segundo códigos pré-estabelecidos (Esbérard e Daemon 1999), ou com anilha numerada em um dos antebraços. 

Serão coletados, no máximo, cinco indivíduos por localidade e os exemplares terão o seu uso maximizado (Meserve 1981, Keymer e Dobson 1987, Dickman e Huang 1988, Simões et al. 2017). Amostras de tecido serão retiradas seguindo procedimentos já estabelecidos (Hwang et al. 2007, Galetti et al. 2016). 

É importante ressaltar que os pesquisadores já possuem todas as licenças de coleta emitidas pelo SISBIO e que todos os procedimentos de captura, marcação e coleta já foram aprovados pelo Comitê de Ética no Uso de Animais (CEUA) do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.

Responsáveis: Mauro Galetti e Pedro Galetti.