Nella seconda fase del progetto sono state effettuate le rilevazioni sul campo nei siti ipogei selezionati, testando metodiche differenti, portatili e non invasive, allo scopo di acquisire informazioni dal punto di vista chimico-fisico, fotogrammetrico, paleobotanico e più in generale sulle dinamiche di frequentazione di queste grotte.
Sono state svolte le seguenti campagne di rilevazione: