Ubuntsu512

組み立てて、直ぐに異動のため発送した。PCケースの箱を利用したが、90度回転させていれる形式であった。

23.03.29
リモートデスクトップまわりを設定したら、ログインループが発生。大抵の場合、NVIDIAドライバー周りとのことで、dpkg -l | grep nvidia で確認したらそもそもインストールされていない？ubuntu-drivers devices  でrecommendを確認し、sudo apt install nvidia-driver-525 でインストール

24.02.24
忙しさにかまけて、１年近く放置していたらしい。
とりあえず、sudo apt update, apt upgrade して、reboot now

brewも入っていなかった。
sudo apt-get install build-essential procps curl file git
/bin/bash -c "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/HEAD/install.sh)"
　｜＿指示されて２コマンドで、.bashrc を編集。brew install gccも実行

brewにあったので、micromambaを入れてみる。
brew install micromamba
　micromamba create -n ONT
　micromamba activate ONT
　micromamba install -y -c conda-forge -c bioconda Nanofilt
　micromamba install -y -c conda-forge -c bioconda NanoPlot
　　とりあえず、正常にインストールされたらしい
　micromamba install -c bioconda -c conda-forge necat
　　#conda-forgeなしだとperlが入らないと怒られた

2024.02.28
Dockerをいれる
curl -fsSL https://get.docker.com -o get-docker.sh
sudo sh get-docker.sh

2024.04.10
Dockerでrnammerを動かす。

docker pull yookuda/rnammer-1.2:1.0
docker run --rm --name test -v (WorkingDirectory):/data  -it  yookuda/rnammer-1.2:1.0
これでWorkingDirectoryがdocker環境内の/dataとして利用できる

2024.07.02
M.2SSDをtemporaryとして/dataにマウントする。
sudo parted /dev/nvme0n1
(parted) mklabel gpt
(parted) mkpart
　Partition name?  []?
　File system type?  [ext2]? ext4
　Start? 0%
　End? 100%
(parted) q
sudo mkfs.ext4 /dev/nvme0n1p1

Singularity のインストール
　sudo yum update -y && \

    sudo yum groupinstall -y 'Development Tools' && \

    sudo yum install -y \

    openssl-devel \

    libuuid-devel \

    libseccomp-devel \

    wget \

    squashfs-tools