FijiのTemplateの流用実行後に指定したディレクトリ(input)にある画像全て(種類はsuffixで指定)を順次処理し、2番に指定したディレクトリ(output)に結果を保存する。なぜかConvert to Maskは2回実行しないと反映されない。
エルピクセルのImageJ plug-inが必要:https://lpixel.net/products/lpixel-imagej-plugins/