I nostri esperimenti

I tipi di esperimenti che facciamo misurano direttamente le proprietà dei batteri viventi (esperimenti in vivo) oppure misurano le proprietà di molecole purificate come i complessi formati tra proteine e DNA (esperimenti in vitro). Una volta che abbiamo purificato la proteina e il DNA che ci interessano possiamo studiare la formazione delle interazioni tra loro. Questo ci aiuterà a scoprire quale parte, o sequenza, del DNA viene riconosciuta da una proteina e come le variabili ambientali, come la temperatura, possono influenzare questa interazione. Nei batteri vivi possiamo misurare la quantità di espressione dei geni e quanto velocemente e quando una data proteina viene prodotta. Per fare questo usiamo una proteina fluorescente, la GFP, che viene prodotta dal batterio. Nell'immagine a destra potete vedere la foto di una capsula di Petri con delle colonie batteriche. Alcune delle colonie contengono batteri con una moderata quantità di proteina fluorescente, altre con un numero maggiore di proteine fluorescenti. Si può misurare la fluorescenza esponendo i batteri alla luce blu e si può eseguire questo tipo di misurazione con un'intera popolazione di batteri, o con un singolo batterio (come in questo video). Nel nostro laboratorio facciamo molti esperimenti, ma lavoriamo anche con fisici e matematici che lavorano con modelli ed esperimenti teorici (esperimenti in silico).