Le type d'expériences que nous faisons soit mesure directement les propriétés des bactéries vivantes (expériences in vivo) soit mesure les propriétés des molécules purifiées telles que les complexes formés entre les protéines et l'ADN (expériences in vitro). Une fois que nous avons purifié la protéine et l'ADN qui nous intéressent, nous pouvons étudier la formation des interactions entre eux. Cela nous aidera à découvrir quelle partie, ou séquence, de l'ADN est reconnue par une protéine et comment des variables environnementales telles que la température peuvent affecter cette interaction. Dans les bactéries vivantes, nous pouvons mesurer la quantité d'expression des gènes, la vitesse et le moment de production d'une protéine donnée, en utilisant une protéine fluorescente, la GFP, produite par la bactérie. Sur la photo de droite, vous pouvez voir une image d'une boîte de Petri avec des colonies de bactéries. Certaines de ces colonies contiennent des bactéries avec un peu de protéine fluorescente, d'autres avec beaucoup plus. On peut mesurer la fluorescence en exposant les bactéries à une lumière bleue. On peut faire ce genre de mesure sur toute une population de bactéries, ou une bactérie à la fois (un exemple dans cette vidéo). Dans notre laboratoire, nous faisons des expériences, mais nous travaillons aussi avec des physiciens et des mathématiciens qui font des modèles, ou des expériences théoriques (expériences in silico).