Interoperabilidade é a capacidade de um sistema (informatizado ou não) de se comunicar de forma transparente (ou o mais próximo disso) com outro sistema (semelhante ou não).
Para um sistema ser considerado interoperável, é muito importante que ele trabalhe com padrões abertos.
Interoperabilidade é também a capacidade de comunicar e executar programas através de várias unidades funcionais, utilizando-se de linguagens e protocolos comuns.
Fonte: http://www.diegomacedo.com.br/o-que-e-interoperabilidade/