Stats

統計的仮説検定とは？

　本ページでは基本的な共通概念として、統計的仮説検定という考え方が出てくる。統計的仮説検定とは得られた標本（サンプル）をもとに、何らかの仮説、例えば「ある標本の平均値は0より大きいか」、「2つの標本は平均値が異なるか」など、を検証するための方法である。統計（特に生物統計）の初学者はつまづきやすいところであるが、知識の普及には至ってない実情があるように思われる。私も学び始めたころは、何を言っているのかちんぷんかんぷんであった。

　ここでは、統計の感覚をつかんでもらうことを目的として、詳細な理論的背景には立ち入らず（偉そうなこと言ってるけど私も勉強中でわっかんね、ってことです）なるべく数式などは用いず（最近、これ嘘ついてるじゃんってなってるけど）、シミュレーションを中心に、解説を行っていく。何かの役に立ててもらえれば幸いである。基本的には初めに「不偏推定量＆「不偏分散の平方根は標準偏差の不偏推定量ではない」と「t分布とt検定＆統計的仮説検定の考え方」を読んでもらえれば、あとはどこを読んでも自由である。

統計ソフトウェアR

　本ページで、シミュレーションをするのに用いるのがソフトウェアRである。フリーソフトウェアであり、生物統計を含めた幅広い領域で使われている。主に統計を行うためのものであるが、一通りの作図もこなすことができる。Statsのページでは、Rのコードを記載することが多いので、手元にRがあれば、自分でシミュレーションを行うことができる。ぜひとも、Rもインストールして臨んでほしい。以下は私がRを学んだ時にお世話になったページである。初学者は紹介したページを一通りこなしてみるとよい。

・R tips http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html (え、ページなくなってる……)

・R でプログラミング：データの一括処理とグラフ描き http://takenaka-akio.org/doc/r_auto/index.html

統計の勉強

　統計自体も理解することも大変だが、それ以上にインターネット上には玉石混合の情報が存在し、それぞれで主張していることが一致していないことも混乱の要因である。以下のページは統計のプロフェッショナルによる、まさに玉と呼べるページであり、私自身も大変お世話になっている。ぜひとも活用しよう。

・奥村晴彦先生のページ https://okumuralab.org/~okumura/

・青木繁伸先生のページ http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/

・井口豊先生のページ https://biolab.sakura.ne.jp/index.html

・ほくそ笑む（hoxo_mさんのページ） https://hoxo-m.hatenablog.com/

・清水裕士先生のページ https://norimune.net/psychmetrics

実践ポリシーは「繰り返しと比較から学ぶ」

　初めから、プログラムコードの１行１行を理解するのは無理だ。本ページでは、ほとんど同じプログラムコードを、省略することなく繰り返し用いる。まずは写経だと思って、載せたコードをそのまま打ち込んで実行してみよう。Ｒでプログラムを繰り返し実行することで、どんなことをやっているかを、実感してほしい。慣れてきたら、似たプログラムでも、どこが違うと、どんな出力の違いが出るかを、確認してみよう。自分であえてプログラムを書き換えて出力がどう変わるか確認するのもよい方法だ。泥臭いが、これが私なりの統計とプログラムを学んできた方法だ。プログラムを書き換えて出力を見るさまは、ちょうど、遺伝学における逆遺伝学の方法に近い感じがする。