│
└─o Ciliophora ou Ciliata
├─o Mesodiniea ou Cyclotrichida
└─o
├─o Postciliodesmatophora
│ ├─o Karyorelictea
│ │ ├─o Wilbertomorphidae
│ │ ├─o Protostomatida
│ │ │ ├─o Kentrophoridae
│ │ │ └─o Trachelocercidae
│ │ └─o
│ │ ├─o Protoheterotrichida
│ │ │ ├─o Geleiidae
│ │ │ └─o Aveliidae
│ │ └─o Loxodida
│ │ ├─o Loxodidae
│ │ └─o Cryptopharyngidae
│ └─o Heterotrichea
│ ├─o Peritromidae
│ └─o
│ ├─o Spirostomidae
│ └─o
│ ├─? Blepharismidae
│ ├─o Climacostomidae
│ └─o
│ ├─? Fabreidae
│ ├─? Gruberiidae
│ ├─o Condylostomatidae
│ └─o
│ ├─o Folliculinidae
│ └─o Stentoridae
└─o Intramacronucleata
├─o SAL ou Lamellicorticata
│ ├─o Spirotrichea
│ │ ├─o Licnophorida
│ │ └─o
│ │ ├─o Phacodiniida
│ │ └─o
│ │ ├─o Kiitrichida oou Protohypotrichia
│ │ │ ├─? Transitellidae
│ │ │ └─o Kiitrichidae
│ │ └─o
│ │ ├─o Euplotia
│ │ │ ├─o Discocephalida
│ │ │ │ ├─o Erionellidae
│ │ │ │ └─o Discocephalidae
│ │ │ └─o Euplotida
│ │ │ ├─o Uronychiidae
│ │ │ └─o
│ │ │ ├─o Gastrocirrhidae
│ │ │ └─o
│ │ │ ├─o Euplotidae
│ │ │ └─o
│ │ │ ├─o Aspidiscidae
│ │ │ └─o Certesiidae
│ │ └─o Perilemmaphora
│ │ ├─o Stichotrichia
│ │ │ ├─o Plagiotomida
│ │ │ ├─o Urostylida
│ │ │ │ ├─o Urostylidae
│ │ │ │ ├─o Pseudourostylidae
│ │ │ │ └─o Pseudokeronopsidae
│ │ │ └─o Stichotrichida et Sporadotrichida
│ │ │ ├─o Trachelostylidae
│ │ │ ├─o Oxytrichidae (en partie)
│ │ │ ├─o Spirofilidae
│ │ │ ├─o Psilotrichidae
│ │ │ ├─o Keronidae
│ │ │ ├─o Amphisiellidae
│ │ │ └─o Kahliellidae
│ │ └─o
│ │ ├─o
│ │ │ ├─o Epiclintidae
│ │ │ └─o Holostichidae
│ │ └─o
│ │ ├─o Oxytrichidae (en partie)
│ │ └─o Oligotrichea
│ │ ├─o Oligotrichia
│ │ │ ├─? Halteriida
│ │ │ └─o Strombidiida
│ │ └─o
│ │ ├─o Lynnellida
│ │ └─o Choreotrichia
│ │ ├─o Choreotrichida
│ │ │ ├─o Strobilidiidae
│ │ │ ├─o Strombidinopsidae
│ │ │ ├─o Leegaardiellidae
│ │ │ └─o Lohmanniellidae
│ │ └─o Tintinnida
│ │ ├─o Dictyocystidae
│ │ ├─o Tintinnidiidae
│ │ ├─o Codonellidae
│ │ ├─o Codonellopsidae
│ │ ├─o Nolaclusiliidae
│ │ ├─o Metacylididae
│ │ ├─o Ascampbelliellidae
│ │ ├─o Epiplocylididae
│ │ ├─o Rhabdonellidae
│ │ ├─o Ptychocylidae
│ │ ├─o Petalotrichidae
│ │ ├─o Cyttarocylididae
│ │ ├─o Xystonellidae
│ │ ├─o Undellidae
│ │ └─o Tintinnidae
│ └─o
│ ├─? Caenomorphidae
│ ├─?
│ │ ├─o Muranotrichea
│ │ └─o
│ │ ├─o Parablepharismea
│ │ └─o Cariacotrichea
│ ├─o Armophorea
│ │ ├─o Metopida
│ │ └─o Clevelandellida
│ │ ├─o Clevelandellidae
│ │ ├─o Nyctotheridae
│ │ ├─o Sicuophoridae
│ │ └─o Neonyctotheridae
│ └─o Litostomatea
│ ├─o Helicoprorodontida
│ └─o
│ ├─o Chaeneidae
│ └─o
│ ├─o
│ │ ├─o Homalozoonidae
│ │ └─o Pleurostomatida
│ │ ├─o Kentrophyllidae
│ │ └─o
│ │ ├─o Amphileptidae
│ │ └─o Litonotidae
│ └─o
│ ├─o Didiniida
│ └─o
│ ├─o
│ │ ├─o Lacrymariidae
│ │ └─o Rhynchostomatia
│ │ ├─o Tracheliida
│ │ └─o Dileptida
│ │ ├─o Monomacrocaryon
│ │ └─o
│ │ ├─o Dimacrocaryonidae
│ │ └─o Dileptidae
│ └─o
│ ├─o Haptorida
│ │ ├─o Pleuroplitidae
│ │ ├─o Acropisthiidae
│ │ ├─o Fuscheriidae
│ │ └─o Enchelyodontidae
│ └─o Spathidiida (paraphylétique)
│ ├─o Actinobolinidae
│ ├─o Spathidiidae
│ ├─o Enchelyidae
│ ├─o Pseudoholophryidae
│ ├─o Trachelophyllidae
│ └─o Trichostomatia
│ ├─o Amylovoracidae
│ ├─o Polycostidae
│ ├─o Vestibuliferida
│ │ ├─o Balantidiidae
│ │ ├─o Isotrichidae
│ │ ├─o Paraisotrichidae
│ │ ├─o Plagiopylidae
│ │ └─o Trimyemidae
│ └─o Entodiniomorphida
│ ├─o Blepharocorythidae
│ ├─o Buetschliidae
│ ├─o Cycloposthiidae
│ ├─o Macropodiniidae
│ ├─o Ophryoscolecidae
│ ├─o Parentodiniidae
│ ├─o Polydiniellidae
│ ├─o Spirodiniidae
│ └─o Troglodytellidae
└─o Ventrata ou CON3P
├─? Pseudotrachelocercidae
├─o Protocruziea ou Protocruziida
└─o
├─o Discotrichida
└─o
├─o Colpodea
│ ├─? Bryophryida ou Bryophryidae
│ ├─o
│ │ ├─o Sorogenida
│ │ └─o
│ │ ├─o Sagittariidae
│ │ ├─? Woodruffiidae
│ │ └─o Platyophryidae
│ └─o
│ ├─o
│ │ ├─o Bursariomorphida
│ │ │ ├─o Bursariidae
│ │ │ └─o Bursaridiidae
│ │ └─o Bryometopida
│ │ ├─o Jaroschiidae
│ │ ├─o Trihymenidae
│ │ ├─o Bryometopidae
│ │ └─o Kreyellidae
│ └─o
│ ├─o Cyrtolophosididae
│ ├─? Grossglockneriida ou Grossglockneriidae
│ └─o Colpodida
│ ├─? Bryophidae
│ ├─? Marynidae
│ ├─o Bardeliellidae
│ └─o
│ ├─o Hausmanniellidae
│ └─o Colpodidae
└─o
├─o
│ ├─o Nassophorea
│ │ ├─o Microthoracida
│ │ │ ├─o Discotrichidae
│ │ │ ├─o Microthoracidae
│ │ │ └─o Pseudomicrothoracidae
│ │ └─o Nassulida
│ │ ├─o Colpodidiidae
│ │ ├─o Nassulidae
│ │ ├─o Furgasoniidae
│ │ └─o Paranassulidae
│ └─o Phyllopharyngea
│ ├─o Synhymenia
│ │ ├─o Nassulopsidae
│ │ ├─o Synhymeniidae
│ │ ├─o Orthodonellidae
│ │ └─o Scaphidiodontidae
│ └─o Subkinetalia
│ ├─o Cyrtophoria (paraphylétique)
│ │ ├─o Chlamydodontida
│ │ │ ├─o Kryoprorodontidae
│ │ │ ├─o Chitonellidae
│ │ │ ├─o Gastronautidae
│ │ │ ├─o Chlamydodontidae
│ │ │ ├─o Chilodonellidae
│ │ │ └─o Lynchellidae
│ │ └─o Dysteriida (paraphylétique)
│ │ ├─o Kyaroikeidae
│ │ ├─o Plesiotrichopidae
│ │ ├─o Hartmannulidae
│ │ ├─o Dysteriidae
│ │ └─o Chonotrichia
│ │ ├─o Cryptogemmida
│ │ │ ├─o Actinichonidae
│ │ │ ├─o Isochonopsidae
│ │ │ ├─o Isochonidae
│ │ │ ├─o Inversochonidae
│ │ │ ├─o Stylochonidae
│ │ │ └─o Echinichonidae
│ │ └─o Exogemmida
│ │ ├─o Phyllochonidae
│ │ ├─o Chilodochonidae
│ │ ├─o Spirochonidae
│ │ ├─o Filichonidae
│ │ ├─o Heliochonidae
│ │ └─o Lobochonidae
│ └─o
│ ├─o Rhynchodia
│ │ ├─o Hypocomatida ou Hypocomidae
│ │ └─o Rhynchodida
│ │ ├─o Sphenophryidae
│ │ └─o Ancistrocomidae
│ └─o Suctoria
│ ├─o Evaginogenida
│ │ ├─o Cyathodiniidae
│ │ ├─o Dendrocometidae
│ │ └─o Discophryidae
│ ├─o Endogenida
│ │ ├─o Dendrosomatidae
│ │ ├─o Trichophryidae
│ │ ├─o Enchelyomorphidae
│ │ ├─o Endosphaeridae
│ │ ├─o Acinetidae
│ │ └─o Tokophryidae
│ └─o Exogenida
│ ├─o Phalacrocleptidae
│ ├─o Stylostomatidae
│ ├─o Rhabdophryidae
│ ├─o Ophryodendridae
│ ├─o Spelaeophryidae
│ ├─o Ephelotidae
│ ├─o Parapodophryidae
│ ├─o Podophryidae
│ ├─o Tachyblastonidae
│ ├─o Metacinetidae
│ ├─o Thecacinetidae
│ ├─o Paracinetidae
│ ├─o Urnulidae
│ └─o Corynophryidae
└─o
├─o
│ ├─o Plagiopylea
│ │ ├─o
│ │ │ ├─o Plagiocampidae
│ │ │ └─o
│ │ │ ├─o Cyclotrichium
│ │ │ └─o Paraspathidium
│ │ └─o
│ │ ├─o Askenasia
│ │ └─o
│ │ ├─o Odontostomatida
│ │ │ ├─o Mylestomatidae
│ │ │ ├─o Discomorphellidae
│ │ │ └─o Epalxellidae
│ │ └─o Plagiopylida
│ │ ├─o Trimyemidae
│ │ └─o
│ │ ├─o Sonderiidae
│ │ └─o Plagiopylidae
│ └─o Prostomatea
│ ├─o Prostomatida
│ │ ├─o Apsiktratidae
│ │ └─o Metacystidae
│ └─o Prorodontida
│ ├─o Malacophryidae
│ ├─o Balanionidae
│ ├─o Urotrichidae
│ ├─o Lagynidae
│ ├─o Holophryidae
│ └─o
│ ├─o Placidae
│ └─o
│ ├─o Porodontidae
│ └─o Colepidae
└─o Oligohymenophorea
├─o Peniculia
│ ├─o Lembadionidae
│ └─o
│ ├─o Paranassulidae
│ └─o
│ ├─o Parameciida
│ │ ├─o Neobursaridiidae
│ │ └─o Parameciidae
│ └─o Frontoniida
│ ├─o Maritujidae
│ ├─o Stokesiidae
│ ├─o Clathrostomatidae
│ └─o Frontoniidae
└─o
├─o Peritrichia
│ ├─o Mobilida
│ │ ├─o Trichodinidae
│ │ ├─o Urceolariidae
│ │ ├─o Leiotrochidae
│ │ ├─o Polycyclidae
│ │ └─o Trichodinopsidae
│ └─o
│ ├─o Urocentrida
│ └─o
│ ├─o Hymenostomatia
│ │ ├─o Ophryoglenina
│ │ │ ├─o Ichthyophthiriidae
│ │ │ └─o Ophryoglenidae
│ │ └─o Tetrahymenina
│ │ ├─o Curimostomatidae
│ │ ├─o Spirozonidae
│ │ ├─o Tetrahymenidae
│ │ ├─o Turaniellidae
│ │ └─o Glaucomidae
│ └─o Sessilida
│ ├─o Termitophryidae
│ ├─o Astylozoidae
│ ├─o Opisthonectidae
│ ├─o Ophrydiidae
│ ├─o Vaginicolidae
│ ├─o Ellobiophryidae
│ ├─o Lagenophryidae
│ ├─o Usconophryidae
│ ├─o Rovinjellidae
│ ├─o Vorticellidae
│ ├─o Zoothamniidae
│ ├─o Operculariidae
│ ├─o Scyphidiidae
│ └─o Epistylididae
└─o Sculicociliatia
├─o Loxocephalidae (paraphylétique ?)
└─o
├─o
│ ├─o Cinetochilidae(en partie)
│ └─o Apostomatia
│ ├─o Pilisuctorida ou Conidophryidae
│ ├─o Astomatophorida ou Opalinopsidae
│ └─o Apostomatida
│ ├─o Colliniidae
│ ├─o Foettingeriidae
│ └─o Cyrtocaryidae
└─o
├─o Cinetochilidae(en partie)
├─o Astomatida
│ ├─o Archiastomatidae
│ ├─o Anoplophryidae
│ ├─o Haptophryidae
│ ├─o Clausilocolidae
│ ├─o Maupasellidae
│ ├─o Intoshellinidae
│ ├─o Contophryidae
│ ├─o Radiophryidae
│ └─o Hoplitophryidae
└─o
├─o
│ ├─o Thigmotrichida
│ │ ├─o Ancistridae
│ │ ├─o Hemispeiridae
│ │ ├─o Hysterocinetidae
│ │ └─o Paraptychostomidae
│ └─o Pleuronematida
│ ├─o Calyptotrichidae
│ ├─o Ctedoctematidae
│ ├─o Histiobalantiidae
│ ├─o Peniculistomatidae
│ ├─o Pleuronematidae
│ ├─o Dragescoidae
│ ├─o Cyclidiidae
│ ├─o Conchophthiridae
│ └─o Thigmocomidae
└─o Philasterida
├─o Thigmophryidae
├─o Urozonidae
├─o Pseudocohnilembidae
├─o Uronematidae
├─o Entorhipidiidae
├─o Entodiscidae
├─o Cryptochilidae
├─o Cohnilembidae
├─o Philasteridae
├─o Thyrophylacidae
├─o Paralembidae
├─o Orchitophryidae
└─o Parauronematidae