微生物菌

真菌：可感染任何種類之昆蟲，具主動及水平傳播特性

病毒、細菌及原生動物：不適用刺吸式口器之昆蟲

bacillus在拉丁文中是短桿狀的意思。subtilis在拉打文中是細長的意思

微生物肥料之功能，有益的土壤微生物種類甚多，不同微生物肥料有不同之功能，其功能主要為：

固氮作用：固氮菌包括共生、附著及游離三類菌，係將空氣中的氮素固定為氨，轉變成作物可以利用的氮源，固氮作用可減少氮肥的施用，如此可減少為製造化學氮肥所消耗的石油能源，也可減緩土壤由於施用化學肥料造成酸化的效應。
溶解作用：土壤中存有許多作物不能利用的不溶性營養元素，如磷酸鈣、磷酸鐵等，需靠溶磷菌將磷溶解後才能被利用，因此，這類菌具有提供作物營養的功能，減少化學肥料的施用，例如溶磷菌。
增進根系營養吸收及生長的作用：微生物肥料中有增進根系營養吸收與生長的菌類，增加根系吸收能力及表面積，即可減少化學肥料的施用，提高土壤中的營養供應效率，如菌根菌。
增加植物對逆境的抗性與病原菌之頡抗：微生物的部分分泌物質對其他生物之生存具有抑制作用，此種微生物可使土壤或植體中病原菌減少甚或死亡，減少病害發生，降低農藥之使用。
促進有機物之分解：大分子之有機物需經由微生物分泌酵素分解成較小的分子或無機物，才能被植物利用。