RAxML-NG の使い方

1．事前にアライメントデータをIQ-TREE Online (http://iqtree.cibiv.univie.ac.at/) でModel Selection からモデル推定する

2．IQ-TREE では標準でBIC モデルで選ばれたベストモデルが出力されるが、RAｘML で使う場合はcorrected Akaike information criterion (AICc) で選択されたモデルを選ぶと良い

※ IQ-TREE Online でのモデル推定は使い方は後述

3．出力された情報を元にモデルを選択する

4．Bootstraping ではNumber of replicates を100 に設定することでブートストラップを100 回行うことができる (オンライン版は最大で100)

5．Submit ボタンを押すと解析が始まる

時間がかかるためE-mail アドレスを入力すると解析完了後にメールで通知される