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新型コロナウイルス感染症に伴う開催方針について
新型コロナウイルス感染症に伴う開催方針について
ハッカソンは予定通り行う予定ですが、個人レベルで体調管理や、手洗い、マスク着用などは心がけてください。もし、途中心配で辞退したい方は、オーガナイザーまでご連絡ください。また、もし急遽大学のほうで、「大多数が集まるイベントは控えるように」といったアナウンスがあった場合は、突然ハッカソンが中止になる可能性もありますのでご了承ください。
ハッカソンは予定通り行う予定ですが、個人レベルで体調管理や、手洗い、マスク着用などは心がけてください。もし、途中心配で辞退したい方は、オーガナイザーまでご連絡ください。また、もし急遽大学のほうで、「大多数が集まるイベントは控えるように」といったアナウンスがあった場合は、突然ハッカソンが中止になる可能性もありますのでご了承ください。
開催期間: 2024年2月17日（土）〜20日（火）
開催場所: 〒260-8675 千葉県千葉市中央区亥鼻1-8-1（医薬系総合研究棟1 718室）
参加費: 無料（希望者は旅費・宿泊費の支給可能 <遠方*から参加の方のみ>）
* 開催場所から100km以上離れた場所からの参加
宿泊費: 自費（宿泊費支給の有無に関わらず、宿は各自で手配してください）
千葉大学近辺のホテル（参考までに）
懇親会費: 自費
参加登録方法: Googleフォーム
参加資格: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの（例: データ、アルゴリズム）がある人
パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定
例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい
SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。
応募締切: 2024年2月10日 24:00
事故等における緊急連絡先:
〒260-8670 千葉県千葉市中央区亥鼻1-8-1（災害治療学研究所104室）
露崎弘毅e-mail: koki.tsuyuzaki@gmail.com
プログラム
1日目（2/17）
8:30 - 10:30 会場設営
10:30 - 14:00 発表打ち合わせ、ディスカッション（宮本丈）
14:00 - 14:20 会場設営
14:20 - 14:30 Opening / 事務連絡
14:30 - 16:40 Bio"Pack"athon 2024#2（ハイブリッド開催、Zoom接続あり）
14:30 ~ 14:40 「Bio"Pack"athonの紹介」 久米慧嗣
14:40 ~ 15:10 「2024年2月版 LLM情報アップデート」 久米慧嗣
15:10 ~ 15:50 「最短で習得するPythonパッケージ開発入門」 露崎弘毅
15:50 ~ 16:00 休憩
16:00 ~ 16:30 「エージェント・ベース・モデル、ポケモン、DAO など」（招待講演） 長田悠生
16:30 ~ 17:00 「研究・金融・OSS」（招待講演） 宮本丈
17:00 - 18:00 Lightning Talk（1人5-10分程度）
露崎弘毅「PyTorchで行列分解をするPythonパッケージPyTorchDecompの開発」
久米慧嗣「chatAI4Rパッケージファミリーの拡張とその他諸々」
西田孝三「なぜパッケージング作業を行うのか?」
坂本七海「マススペクトルにおける脂質クラス分類モデル予測用Pythonパッケージの実装」
岡昂輝「リピドミクスデータをCytoscape上の代謝パスウェイに投影するRパッケージの開発」
長田悠生「Libraries.io の紹介など」
ニッタジョエル「無料プログラミングワークショップの翻訳を可能にするRパッケージdovetailの紹介」
18:00 集合写真撮影
19:00 - 21:00 : 有識者会議
2日目（2/18）
8:30 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 17:00 ハッカソン
17:00 - 18:00 ディスカッション
3日目（2/19）
8:30 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 18:00 ハッカソン
17:00 - 18:00 ディスカッション
18:00 - 18:30 ラボツアー
4日目（2/20）
8:30 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 17:15 ラップアップ
17:15 - 会場撤去
オーガナイザー
露崎弘毅（千葉大学）
問い合わせ先
koki.tsuyuzaki@gmail.com
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