Bio"Pack"athon
2023 #8
新型コロナウイルス感染症に伴う開催方針について
ハッカソンは予定通り行う予定ですが、個人レベルで体調管理や、手洗い、マスク着用などは心がけてください。もし、途中心配で辞退したい方は、オーガナイザーまでご連絡ください。また、もし急遽大学のほうで、「大多数が集まるイベントは控えるように」といったアナウンスがあった場合は、突然ハッカソンが中止になる可能性もありますのでご了承ください。
開催期間: 2023年8月17日（木）〜20日（日）
開催場所: 〒606-0823 京都市左京区下鴨半木町１-５ 教養教育共同化施設「稲盛記念会館」（講義室101）
URL: https://kyoto3univ.jp/p170
特記事項
会場で事前に用意されているネット環境はeduroamでの接続のみを想定しています
eduroamのアカウントが無い方は、こちらでモバイルWifiを用意するため、Googleフォームで「モバイルWifi支給の希望」で「はい」を選択してください
モバイルWifiは大規模なデータをダウンロードするのには適していないため、事前に各自のPCや、外付けHDDなどにデータのコピーをお願いします
参加費: 無料（希望者は旅費・宿泊費の支給可能 <遠方*から参加の方のみ>）
* 開催場所から50km以上離れた場所からの参加
宿泊費: 自費（宿泊費支給希望者以外、宿は各自で手配してください）
京都四条近辺のホテル（参考までに）
懇親会費: 自費
参加登録方法: Googleフォーム
参加資格: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの（例: データ、アルゴリズム）がある人
パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定
例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい
SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。
応募締切: 2023年7月31日 24:00
事故等における緊急連絡先:
〒606-8522 京都府京都市左京区下鴨半木町1-5 京都府立大学大学院 生命環境科学研究科 植物ゲノム情報学研究室（3号館2階 3218室）
福島敦史e-mail: afukushima@kpu.ac.jp
プログラム
1日目（8/17）
14:00 - 15:50 会場設営（オーガナイザーのみ）
15:50 - 16:00 Opening / 事務連絡
16:00 - 17:00 Lightning Talk（1人5-10分程度）
露崎弘毅「Out-of-CoreかつSparseなテンソル演算パッケージDelayedTensorのチューニング」
福島敦史「Rパッケージングテクを磨く」
久米慧嗣「chatAI4Rパッケージの機能拡張 + α」
山本博之「mseapcaパッケージの開発とCRANへの再登録」
西田孝三「R パッケージの Python reimplementation の例と pyOpenSci の紹介」
長田悠生「環境の変動が観測される遺伝的アルゴリズムのpackage化」
17:00 集合写真撮影
17:00 - 18:00 Bio"Pack"athon 2023#8_1（ハイブリッド開催、Zoom接続あり）
久米慧嗣「Bio"Pack"athonの紹介」
久米慧嗣「chatAI4Rパッケージの紹介 & 使用方法デモ」
露崎弘毅「ワークフローツールの開発」
19:00 - 22:00 : 有識者会議
2日目（8/18）
10:00 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 17:00 ハッカソン
17:00 - 18:00 ディスカッション
3日目（8/19）
10:00 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 17:00 ハッカソン
17:00 - 18:00 ディスカッション
4日目（8/20）
10:00 - 12:00 ハッカソン
12:00 - 13:00 Lunch Break
13:00 - 14:00 ラップアップ Bio"Pack"athon 2023#8_2（ハイブリッド開催、Zoom接続あり）
14:00 - 会場撤去
オーガナイザー
福島敦史（京都府立大学）
露崎弘毅（千葉大学）
久米慧嗣（Bio"Pack"athon）
問い合わせ先
koki.tsuyuzaki@gmail.com