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https://biopackathon.connpass.com/event/195344
開催日時: 2020年12月9日(水) 17:00 〜
開催場所: Zoom (URLは追って記します)
会の目的: About をご参照ください
こんな方をターゲットとして想定しています: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの(例: データ、アルゴリズム)がある人
(主にBioconductorの)パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定
例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい
SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。
プログラム
17:00 ~ 17:10, Bio"Pack"athonの紹介 @kozo2
17:10 ~ 17:30, 画像解析関連のRパッケージについて〜ANTsRNetを使った画像解析の話も〜 @skume
17:30 ~ 17:45 「社内microbiomeデータ可視化ツールcynyのその後のdevelop」 @satopan_wa
17:45 ~ 19:30, パッケージ開発 (開発計画の共有、それに関する質問など)
19:30 ~ 20:00, まとめ
ラップアップ資料