BioPackathon2020#2
開催日時: 2020年5月15日(金) 18:00 〜
開催場所: Zoom (URLは追って記します)
connpass: https://biopackathon.connpass.com/event/175293/
会の目的: About をご参照ください
こんな方をターゲットとして想定しています: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの(例: データ、アルゴリズム)がある人
(主にBioconductorの)パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定
例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい
SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。
プログラム (第1部 [発表]) 18:00~18:50
18:00 ~ 18:10 西田孝三 「本会のすすめ方の説明」
18:10 ~ 18:30 佐藤建太 「Juliaのパッケージング事情」
18:30 ~ 18:50 露崎弘毅 「R-4.0の解説」
18:50 ~ 19:10 西田孝三 「最近のBioconductorのコミュニティ活動の紹介(community advisory boardの経験から)」
各発表は下記のようにYouTubeで公開しています。
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プログラム (第2部 [もくもく会など]) 19:00 ~
19:00 ~ 各自のパッケージ計画の情報共有
19:10 ~ もくもく会 (主にBioconductorのパッケージ作成についての情報交換を行います。)
21:00 ~ もくもく会結果の共有
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