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開催日時: 2020年5月29日（金） 18:00 〜
開催場所: Zoom (URLは追って記します)
connpass: https://biopackathon.connpass.com/event/176588/
会の目的: About をご参照ください
こんな方をターゲットとして想定しています: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの（例: データ、アルゴリズム）がある人
(主にBioconductorの)パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定
例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい
SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。
プログラム (第1部 [発表]) 18:00~18:50
18:00 ~ 18:10 西田孝三 「BioPackathonの紹介」
18:10 ~ 18:30 西田孝三 「GitHub ActionsでBiocCheckしよう」
各発表は下記のようにYouTubeで公開しています。
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プログラム (第2部 [もくもく会など]) 19:00 ~
19:00 ~ 各自のパッケージ計画の情報共有
19:10 ~ もくもく会 (主にBioconductorのパッケージ作成についての情報交換を行います。)
21:00 ~ もくもく会結果の共有
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西田 https://github.com/ecell/transomics2cytoscape のBiocCheck
福島 https://github.com/afukushima/rRPMM のBiocCheck
露崎 最近のR packageのサーベイ
久米 Wikidataのネットワーク可視化のR package化の検討
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