BioPackathon2020#9

開催日時: 2020年9月9日(水) 17:00 〜

開催場所: Zoom (URLは追って記します)

会の目的: About をご参照ください

こんな方をターゲットとして想定しています: 普段から生命科学のデータに携わっており、パッケージ化したいもの(例: データ、アルゴリズム)がある人

    • (主にBioconductorの)パッケージング作業がメインなので、当日何をパッケージ化するか決まっている人を想定

      • 例1: 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい

      • 例2: Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい

      • 例3: あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい

      • 例4: ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい

      • 例5: 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい

    • SlackにBiopackathonのワークスペースがあります。参加登録前のご相談などありましたら招待リンク からお気軽にご参加ください。


プログラム

  • 17:00 ~ 17:10, BioPackathonの紹介 @kozo2

  • 17:10 ~ 17:40, BioC2020のワークショップの一つ「Create A Package」の紹介 @kozo2

  • 17:40~ 18:00, コード、データ、計算環境をまるごと公開するサービスCode Ocean@antiplastics

  • 18:00 ~ 19:40, パッケージ開発(パッケージ計画の情報交換、質問など)

  • 19:40 ~ 20:00, まとめ


ラップアップ


biopackathon009_yamamoto