Entre noviembre de 2002 y octubre de 2003 la Unidad participó con Personal y Material en misiones de apoyo en la crisis del Prestige. La participación de personal de vuelo y tierra fue realizada por 60 oficiales pilotos, 30 suboficiales tripulantes aéreos, 20 suboficiales de equipos de tierra (averías aviones), 3 oficiales, 14 suboficiales y 124 militares de tropa profesional de apoyo en tierra. Se mantuvieron destacamentos aéreos basados en los Aeropuertos de Santiago, Asturias y Santander, realizándose un total de 1.770 horas de vuelo en misiones de inspección y vigilancia de las manchas de fuel. A partir del 20 de mayo de 2.003 se desactivaron los destacamentos y las misiones se realizan desde la Base Aérea de Villanubla. El último vuelo realizado fue el 21 de octubre de 2004 continuándose en la actualidad ON CALL para posibles salidas.
Tambien hubo Renos ayudando a pie de playa.