tRNAによる遺伝暗号解読を行わない例外的な遺伝暗号解読機構である終止コドンの解読機構について、tRNA擬態タンパク質分子であるペプチド鎖解因子（RF）を中心に研究しています。

64通りのうち61コドンは、タンパク質を構成する20種類のアミノ酸のどれか一つとして解読されますが、残りの3コドンはアミノ酸に対応しておらず、リボソームによる翻訳反応完了の指令として解読されるため終止コドンと呼ばれます。アミノ酸に対応するコドンの解読には、tRNAというL字型立体構造（図A）をもつ機能性核酸分子がそれぞれのコドンに対応したアダプターとなることが解明され、それ以来この半世紀で数多くの研究者がtRNAによるコドン解読機構の研究で功績を残し、膨大な成果が蓄積しています。そして、tRNAが関わる病気の発症機構解明や治療応用、新規な機能性タンパク質の合成など、多様な医工学的応用研究へと発展しています。しかしながら終止コドンの解読にはtRNAが関与しないため、異端として長らく研究の主流から置き去りにされてきました。意外なことですが、Watson-Crickの二重らせん発見以来の分子生物学の教科書は、「どのような分子原理で終止コドンが解読されるのか？」という生物学上の基本的な問いに 長らく答えてこなかったのです。我々の研究室ではこれまで、分子遺伝学解析手法を中心に、生化学・構造生物学的解析との連携により、かの問いに答えるべく終止コドンの解読機構の基本分子メカニズムの解明を目指してきました。そして、研究の途上で次第に明らかになってきたことは、終止コドン解読にはtRNAのような機能性を獲得したRFと呼ばれるタンパク質分子がリボソームで機能するという事実でした。

生命の物質進化では最初に機能性核酸分子が中心の原始生命系が誕生したという仮説が提唱されています（RNAワールド仮説）。tRNAは、その主要成分がRNAであるリボソームと共に現存生物の共通祖先となる原始細胞完成以前に機能を完成させたRNA分子化石と考えられています（図A）。ですから、タンパク質によるtRNA分子擬態は、進化の歴史上は後発だがより多彩な物理化学的な特性を兼ね備えた新参者であるタンパク質分子による核酸機能の戦略的乗っ取りとも考えられるのかも知れません。