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Biología Computacional
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2. Limpieza de lecturas
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Ion Torrent
3. Ensamble de genomas
Características
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4. Scaffold
5. Sintonía de genomas
6. Anotación de genomas
7. Visualización de genomas
Genómica comparativa
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Panseq
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Metagenómica 16S/18S
1. Metadatos
2. Limpieza
Illumina pair-end
Ion Torrent
3. Descontaminación
3.1 Quimeras
3.2 Descontaminación
3.3 Dominios
3.4 Eucariontes
4. Clasificación
Comparación DB
Comparación regiones
mg_classifier
Microbioma
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OTUs
QIIME 1.5
QIIME.biobacter.sh
RDP
5. Diversidad
6. Visualización
Sankey
FigSankey
Krona
R plot
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7. Análisis estadísticos
Paso a paso
Pipeline viejo
Metagenómica shotgun
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Anvi'o fasta
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Visualización
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Taxonomía y filogenia
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Bioinformática microbiana
Generalidades Linux
En este apartado veremos algunas generalidades de Linux y comandos básicos.
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