Member

２０１７年４月現在のメンバー

教授：青木一洋 Kazuhiro Aoki

助教：近藤洋平 Yohei Kondo

研究員：小田茂和 Shigekazu Oda

研究員：後藤祐平 Yuhei Goto

研究員：伊藤玲奈 Reina E Ito

特別共同利用研究員：三浦晴子 Haruko Miura

特別共同利用研究員：宇田耀一 Youichi Uda

特別共同利用研究員：真流玄武 Gembu Maryu

技術支援員：海老根映美 Emi Ebine

技術支援員：小野田香織 Kaori Onoda

青木 一洋 Kazuhiro Aoki： 教授

k-aoki[at]nibb.ac.jp

出身： 生まれは香川県、育ちは滋賀県安土。

学歴・職歴： 彦根東高→名大理物理→阪大医科学修士・博士→京大博士研究員→京大生命助教→さきがけ兼任→京大生命講師→京大医特定准教授（生命動態）→岡崎統合バイオ・基生研教授

一言： 2016年4月1日付けで着任しました。期待値だけで採用されたようなものですが、期待を裏切らないように頑張りつつ、当面は腰を据えて細胞生物学の重要な問題に取り組みたいと思います。

発表論文は「Google Scholar」、「Research Gate」。

詳細な経歴、受賞、業績、研究費獲得状況などは「ReeD & Researchmap」へ。

査読履歴（Review records）は「Publons」へ。

その他の情報は「CV」へ。

細胞生物学会の巻頭言を書きました。日頃思っていることをつらつら書きました。

近藤 洋平 Yohei Kondo： 助教

出身： 佐賀県

学歴・職歴： 東大物理（金子研）→京大情報特定助教（生命動態）→ 岡崎統合バイオ・基生研助教

一言： 物理モデリングと統計モデリングを組み合わせ、細胞の謎に迫ります。

発表論文は「Google Scholar」へ。

小田 茂和 Shigekazu Oda： 研究員（CREST）

出身：新潟生まれマレーシア育ち

職歴・学歴： 慶應理工（岡研）→東大理（飯野研）→MRC分子生物学研究所（de Bono研）→基生研ポスドク

一言：生命システムにおける情報処理のダイナミクスの研究とそのための技術開発をしています。

発表論文は「Google Scholar」へ。

後藤 祐平 Yuhei Goto：研究員（NIBBリサーチフェロー）

y-goto[at]nibb.ac.jp

出身：大分県

学歴・職歴：私立東明高校→東大理２→東大生化→東大院生化修士・博士→基生研ポスドク

一言：渋くて堅い研究をやりたいです。

発表論文は「Google Scholar」へ。

三浦 晴子 Haruko Miura： 京都大学大学院生命科学研究科 D2, 学振DC1、特別共同利用研究員

miura.haruko.72e[at]st.kyoto-u.ac.jp

出身： Born in Japan, raised in Germany 日本語もOK

一言： My current research interest focuses on understaning how cell-to-cell variability in signaling dynamics controls cell fate.

  1. Linnemann JR, Meixner LK, Miura H, Scheel CH. An Organotypic 3D Assay for Primary Human Mammary Epithelial Cells that Recapitulates Branching Morphogenesis. Methods Mol Biol. 2017; 1612:125-137. doi: 10.1007/978-1-4939-7021-6_9.
  2. Linnemann JR, Miura H, Meixner LK, Irmler M, Kloos UJ, Hirschi B, Bartsch HS, Sass S, Beckers J, Theis FJ, Gabka C, Sotlar K, Scheel CH. Quantification of regenerative potential in primary human mammary epithelial cells. Development. 2015;142(18):3239-51. doi: 10.1242/dev.123554.
  3. Miura H, Matsuda M, Aoki K. Development of a FRET biosensor with high specificity for Akt. Cell Structure and Function, 2014, 39; 9-20. 2014年度日本細胞生物学会論文賞（CSF Award ）受賞
  4. Drazic A, Miura H, Peschek J, Le Y, Bach NC, Kriehuber T, Winter J. Methionine oxidation activates a transcription factor in response to oxidative stress. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013;110(23):9493-8. doi: 10.1073/pnas.1300578110

宇田 耀一 Youichi Uda: 京都大学大学院医学研究科 D1、学振DC2（H29から）、特別共同利用研究員

uda.youichi.86r[at]st.kyoto-u.ac.jp

出身： 兵庫県

一言： 細胞の光刺激系の開発と光刺激による細胞内シグナル伝達の動態を明らかにしたい。

その他： 苦中楽有り、くじけず頑張っていきたいと思います。

    1. Uda Y, Goto Y, Oda S, Kohchi T, Matsuda M, Aoki K. Efficient synthesis of phycocyanobilin in mammalian cells for optogenetic control of cell signaling. Proc Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2017, in press, doi: 10.1073/pnas.1707190114
    2. Uda Y, Xu S, Matsumura T, Takei Y. P2Y4 Nucleotide Receptor in Neuronal Precursors Induces Glutamatergic Subtype Markers in Their Descendant Neurons. Stem Cell Reports. 2016;6(4):474-82. doi: 10.1016/j.stemcr.2016.02.007.
    3. Suehiro K, Nakamura Y, Xu S, Uda Y, Matsumura T, Yamaguchi Y, Okamura H, Yamashita T, Takei Y. Ecto-domain phosphorylation promotes functional recovery from spinal cord injury. Sci Rep. 2014;4:4972. doi: 10.1038/srep04972

真流 玄武 Gembu Maryu： 京都大学大学院生命科学研究科 D1、学振DC2（H29から）、特別共同利用研究員maryu.gembu.73u[at]st.kyoto-u.ac.jp

出身： 千葉県

一言： 硬派な研究者を目指します。

    1. Maryu G, Matsuda M, Aoki K. Multiplexed fluorescence imaging of ERK and Akt activities and cell-cycle progression. Cell Structure and Function, 2016, 41:81-92. doi: 10.1247/csf.16007. 2014年度日本細胞生物学会論文賞（CSF Award ）受賞

伊藤 玲奈 Reina Itoh： 研究員

ireina[at]nibb.ac.jp

出身etc：愛知県稲沢市平和町。

京都での核家族生活から一転、のどかな田舎の実家に戻り、

祖父母、父母、私たち夫婦と子の4世代での同居生活を始めました。

一言：Cell Biology→Drosophila→Cell Biologyと実験系も出戻りました。

皆さんのお役に立てるようにがんばります。縁の下の力持ちになります！

  1. Takayama Y, Itoh RE, Tsuyama T, Uemura T. Age-dependent deterioration of locomotion in Drosophila melanogaster deficient in the homologue of amyotrophic lateral sclerosis. Genes Cells. 2014; 19(6):464-77. doi: 10.1111/gtc.12146.
  2. Itoh RE, Kiyokawa E, Aoki K, Nishioka T, Akiyama T, Matsuda M. Phosphorylation and activation of the Rac1 and Cdc42 GEF Asef in A431 cells stimulated by EGF. J Cell Sci. 2008;121(Pt 16):2635-42. doi: 10.1242/jcs.028647.
  3. Yamana N, Arakawa Y, Nishino T, Kurokawa K, Tanji M, Itoh RE, Monypenny J, Ishizaki T, Bito H, Nozaki K, Hashimoto N, Matsuda M, Narumiya S. The Rho-mDia1 pathway regulates cell polarity and focal adhesion turnover in migrating cells through mobilizing Apc and c-Src. Mol Cell Biol. 2006;26(18):6844-58.
  4. Fujioka A, Terai K, Itoh RE, Aoki K, Nakamura T, Kuroda S, Nishida E, Matsuda M. Dynamics of the Ras/ERK MAPK cascade as monitored by fluorescent probes. J Biol Chem. 2006;281(13):8917-26.
  5. Itoh RE, Kurokawa K, Fujioka A, Sharma A, Mayer BJ, Matsuda M. A FRET-based probe for epidermal growth factor receptor bound non-covalently to a pair of synthetic amphipathic helixes. Exp Cell Res. 2005;307(1):142-52.
  6. Kurokawa K, Itoh RE, Yoshizaki H, Nakamura YO, Matsuda M. Coactivation of Rac1 and Cdc42 at lamellipodia and membrane ruffles induced by epidermal growth factor. Mol Biol Cell. 2004;15(3):1003-10.
  7. Yoshizaki H, Ohba Y, Kurokawa K, Itoh RE, Nakamura T, Mochizuki N, Nagashima K, Matsuda M. Activity of Rho-family GTPases during cell division as visualized with FRET-based probes. J Cell Biol. 2003;162(2):223-32.
  8. Itoh RE, Kurokawa K, Ohba Y, Yoshizaki H, Mochizuki N, Matsuda M. Activation of rac and cdc42 video imaged by fluorescent resonance energy transfer-based single-molecule probes in the membrane of living cells. Mol Cell Biol. 2002;22(18):6582-91.

海老根 映美 Ebine Emi： 技術支援員

e-ebineq-bio[at]nibb.ac.jp

出身: 東京

学歴・職歴: 茨大理→帝京大医（小児、生化）→医科歯科大（岡部研）→東大（岡部研）→感染研（野崎研）→基生研

一言: 今までの経験を生かして皆さんのお役に立てるよう頑張ります。

小野田 香織 Kaori Onoda： 技術支援員

q-bio[at]nibb.ac.jp

出身： 愛知県岡崎市

一言： 皆さんの研究活動が円滑に進むようにお手伝いできたらと思います。

過去の在籍者と代表的な論文

小松原 晃 Akira T Komatsubara: 京大生命、学振DC2、基生研特別共同利用研究員（2014/4-2017/3） --> 理研QBiC岡田研研究員

  1. Komatsubara AT, Matsuda M, Aoki K. Quantitative analysis of recombination between YFP and CFP genes of FRET biosensors introduced by lentiviral or retroviral gene transfer. Sci Rep, 2015, 5; 13283

高遠 美貴子 Mikiko Takato：NIBBインターンシップ生（2016/9-2016/12）

Ayako McGregor：AMGEN Summer Student. 2ヶ月間当研究室で実験しました。

藤田 芳久 Yoshihisa Fujita：京大医学研究科(MD-PhDコース) 学振DC1（2010/4-2015/3）--> MD --> 京大情報学研究科ポスドク

    1. Fujita Y, Komatsu N, Matsuda M, Aoki K. FRET-based quantitative analysis of feedforward and feedback loops in EGFR signaling and the sensitivity to molecular targeting drugs. FEBS Journal, 2014, 281; 3177-92

定家 和佳子 Wakako Sadaie：京大生命科学研究科、学振DC1（2010/4-2015/3） --> 製薬会社に就職

2013年10月 EMBL symposium "Seeing is believing - Imaging the Processes of Life" にてポスター賞（３位）をいただきました。

    1. Sadaie W, Harada Y, Matsuda M, Aoki K. Quantitative in vivo fluorescence cross-correlation analyses highlight the importance of competitive effect in the regulation of protein-protein interactions. Molecular and Cellular Biology, 2014, 34; 3272-90

小松 直貴 Naoki Komatsu：京大生命科学研究科、学振DC1（2009/4-2014/3） --> 京大生命助教 --> 理研宮脇研研究員

    1. Komatsu N, Fujita Y, Matsuda M, Aoki K. mTORC1 upregulation via ERK-dependent gene expression change confers intrinsic resistance to MEK inhibitors in oncogeneic KRas-mutant cancer cells. Oncogene, 2015, 34; 5607-5616
  1. Komatsu N, Aoki K , Yamada M, Yukinaga H, Fujita Y, Kamioka Y, Matsuda M. Development of an optimized backbone ofFRET biosensors for kinases and GTPases. Molecular Biology of the Cell. 2011;22:4647-56.

国田 勝行 Katsuyuki Kunida：京大医学研究科、学振DC2、博士研究員 （2008/4-2012/3）--> 東京大学黒田真也研究室博士研究員

  1. Kunida K, Matsuda M, Aoki K. FRET imaging and statistical signalprocessing reveal positive and negative feedback loops regulating themorphology of randomly migrating HT-1080 cells. Journal of Cell Science, 2012;125(Pt 10):2381-92.