マニュアル

  • CBB staing

  • PBS

  • RB

  • SDS-PAGE

  • Silver staing

  • TAE

  • TB

  • TBS

  • TE

  • Transfer buffer

  • Trypsin

  • LB

  • SC-X

  • Super broth

  • YPDA

  • YT

<Buffer>

CBB staing

CBB solution

  • Coomassie brilliant blue 1 g

  • 25% Iso-propylalcohol 250 ml

  • 10%Acetic acid 100 ml/ L

※Autoclaveしない!

x10 PBS

  • NaCl 80 g

  • KCl 2 g

  • Na2HPO4 11.5 g (無水の場合)

  • KH2PO4 2 g/ L

※pHを調整しなくても、既にpH7.4になっている

RB

100 mM MES 21.3 g

0.5 mM MgCl2・6H 2O 101.6 mg

1 mM EGTA 380.4 mg/ L

SDS-PAGE

30% Acrylamide

  • 29.2% Acrylamide 29.2 g

  • 0.8% Bis 0.8 g/100 ml

※Autoclaveしない!


x10 Running buffer

  • 250 mM Tris base 30.3 g

  • 1920 mM Glycine 144.1 g

  • 1% SDS 10 g/ L

※Autoclaveしない!


Separating gel (pH8.8)

  • 1.5 M Tris base 90.9 g

  • 0.4 % SDS 2 g/ 500 ml

※Autoclaveしない!

※HClでpH8.8に調整


Stacking gel (pH6.8)

  • 0.5 M Tris base 30.3 g

  • 0.4 % SDS 2 g/ 500 ml

※Autoclaveしない!

※HClでpH6.8に調整


x4 Sample buffer (pH6.8)

  • 250 mM Tris base 3 g

  • 8 % SDS 8 g

  • 40 % Glycerol 40 ml (比重1.261g/mlなので50.44g)

  • 20 % 2ME 20 ml/ 100 ml

※Autoclaveしない!

※4℃保存

Silver staining

Solution A

  • 50% MeOH 250 ml

  • 10% Acetic acid 50 ml/ 500 ml


Solution B

  • 5% MeOH 25 ml

  • 7% Acetic acid 35 ml

  • 1% Glutaladehyde 5 ml/ 500 ml


x10 Silver mix

(1) NaOH (solid) 0.75 g/ NH 4OH 14 ml

(2) Silver Nitrate 8 g/ 100 ml

※使用時に(1)、(2)を等量加えて10倍希釈

※(1)は長期保存できないので注意!


Developer

  • 0.005% Citrate 25 mg

  • 0.019% Folmalin 95 mg/ 500 ml

x50 TAE (pH8.5)

  • 2 M Tris base 242.0 g (Tris-HClではない)

  • 5.71% Acetic acid 57.1 ml

  • 50 mM EDTA・2Na 18.6 g/ L (EDTAの場合は14.6g/L)

※Autoclaveしない!

※NaOHでpH8.5に調整

TB

  • 10 mM PIPES 0.60 g

  • 15 mM CaCl2 ・2H2O 0.44 g

  • 250 mM KCl 3.72 g/ 190 ml

※KOHでpH6.7に調整


  • 55 mM MnCl2・4H2O 2.18 g/ 200 ml

(MnCl2・2H2O1.78 g)

x10 TBS (pH7.4)

  • 250 mM Tris base 30 g

  • 1.5 M NaCl 88 g/ L

※Autoclave後、x1に希釈してTween-20を0.1%加える。

TE (pH8.0)

  • 10 mM Tris base 121 mg

  • 1 mM EDTA・2Na 37.2 mg/ 100 ml

Tarnsfer buffer (pH8.3)

  • 25 mM Tris base 9 g

  • 192 mM Glycine 43.2 g

  • 20 % MeOH 600 ml

  • 0.1 % SDS 3 g/ 3 L

※Autoclaveしない!

※4℃保存

x25 Trypsin

  • 1.25% Trypsin 1.25 g

  • 0.5% EDTA 0.5 g/ PBS 100 ml を先に作りNaOHでpHを調整後にTrypsinを入れる

※4℃で攪拌しながらよく溶かす。o/n(新しいTrypsinはすぐ解けるのでO/N&遠心必要なし)

→5,000 rpm, 5 min遠心した上清をfiltration

→-20℃保存