A FUNEG é composta por um conselho deliberativo, por uma diretoria e por um conselho fiscal, onde todos os cargos são exercidos gratuitamente.
O Conselho Deliberativo é o órgão máximo da FUNEG é formado por representantes do Colégio Estadual José Chiochetta, da Unidade Mista de Saúde Guabiju, da Mitra Diocesana - Paróquia São Pedro, do Poder Público Municipal, da Câmara de Vereadores Municipal, do CPM e por dois conselheiros vitalícios. Este concelho tem como poderes eleger a Diretoria e Conselho Fiscal, aprovar contas e também pedir a extinção da FUNEG.
O Conselho Fiscal é formado por 6 pessoas eleitas para examinar, relatar e fiscalizar a entidade.
A Diretoria trabalha na coordenação de projetos sociais e ecológicos e também elabora planos de manutenção e conservação do parque ecológico.
Presidente: ELIZANDRA FRIZON POMATI
Vice-Presidente: FERNANDA GARDA
Secretária: LIDIA DOS SANTOS ALVES
Tesoureiro: FERNANDO RODRIGUES DA SILVA
Diretor de Patrimônio: DOUGLAS GARDA