Sa Shinigami Academy, kung saan ang mga Meisters at kanilang Demon Weapons ay nagtutulungan upang mangolekta ng 99 na kaluluwa ng tao at isang kaluluwa ng masamang espiritu upang lumikha ng makapangyarihang Death Scythe. Ang kwento ay sumusunod sa mga pangunahing tauhan tulad nina Maka at Soul, Black☆Star at Tsubaki, at Death the Kid kasama ang kanyang twin weapons na sina Patty at Liz. Ang anime ay puno ng aksyon, dark humor, at mga temang tungkol sa pagkakaibigan at pagtuklas sa sarili.