Inilalarawan ng serye ang iba't ibang pagsubok nina Miaka Yuki at Yui Hongo, dalawang mag-aaral sa junior high school. Habang nasa library isang araw, nakatagpo sina Miaka at Yui ng kakaibang libro na kilala bilang The Universe of the Four Gods. Ang pagbabasa ng aklat na ito ay nagdadala sa kanila sa uniberso ng nobela sa sinaunang Tsina.