Ang mga mag-aaral sa second-year high school, sina Haruka Nanase at Makoto Tachibana, ay nakatagpo ng first-year transfer student, si Nagisa Hazuki, isang kapwa miyembro ng team sa isang lokal na swim club noong mga bata pa sila. Ang trio ay palihim na pumasok sa kanilang lumang pool building upang maghukay ng isang time capsule na kanilang ibinaon noong sila ay muling nakasama ni Rin Matsuoka, ang pang-apat na miyembro ng kanilang dating team na umalis noong middle school upang mag-aral sa Australia.