Patuloy na hinahanap ni Conan Edogawa ang paraan upang maibalik ang kanyang tunay na anyo mula sa pagiging bata. Sa season na ito, maraming mga bagong kaso ang kanyang hinaharap, mula sa mga misteryosong pagpatay hanggang sa mga nakakabinging enigmas. Kasama ang kanyang mga kaibigan, tulad nina Ran at Kogoro, ginagamit ni Conan ang kanyang talino at mga kakaibang kakayahan upang lutasin ang mga krimen. Sa kabila ng mga hamon, lumalabas ang kanyang tunay na determinasyon at dedikasyon sa paghahanap ng katarungan.