学会発表

2022

北尾晃一、庄司日和、宮沢孝幸、中川草. 卵生哺乳類ゲノムに内在化したレトロウイルス由来のエンベロープタンパク質の細胞融合活性. 第45回 日本分子生物学会年会. 千葉. (2022) [ポスター発表]

坂口翔一、浦山俊一、高木善弘、布浦拓郎、中川草. NeoRdRpデータベース – 多様なRNAウイルスの同定を目指して. 第45回 日本分子生物学会年会. 千葉. (2022) [ポスター発表]

中川草. 大規模シークエンスデータ解析が明らかにするRNAウイルスの生態系. 日本微生物生態学会. 北海道. (2022) [ポスター発表]

坂口翔一、中川草、浦山俊一、高木善弘、布浦 拓郎、中野隆史. RNAウイルス叢検索データセット”NeoRdRp”を用いた海洋メタトランスクリプトーム解析. 日本微生物生態学会, 北海道. (2022) [ポスター発表]

Koichi Kitao, Shoji Hiyori, Takayuki Miyazawa, So Nakagawa. Endogenous retroviruses in egg-laying mammals and the fusogenic property of an envelope protein in echidna. 6th Uppsala Transposon Symposium. Uppsala, Sweden. (2022). [ポスター発表]

Ryo Yanagiya, Ai Kotani, So Nakagawa. 急性骨髄性白血病の内在性ウイルス発現はイノシトールリン酸代謝系酵素の発現と相関する. 第84回日本血液学会学術集会. 福岡. (2022) [口頭発表]

中川草、坂口翔一、浦山俊一、高木善弘、布浦拓郎. 多様なRNAウイルス同定を目指したNeoRdRpデータベースの構築. 日本遺伝学会第94回大会, 北海道. (2022) [口頭発表]

峯田克彦、中川草. 遺伝学・生命科学への AI・機械学習の活用. 日本遺伝学会第94回大会, 北海道. (2022) [口頭発表]

北尾晃一、宮沢孝幸、中川草. Open reading frameが保存されたLINEレトロトランスポゾン座位の同定. 日本遺伝学会第94回大会, 北海道. (2022) [口頭発表]

庄司日和、北尾晃一、宮沢孝幸、中川草. 新世界ザルで明らかになった syncytin 遺伝子の機能多様性とウイルス由来遺伝子の進化モデルの構築. 日本遺伝学会第94回大会, 北海道. (2022) [口頭発表]

坂口翔一、中川草、浦山俊一、高木善弘、布浦拓郎、中野隆史. RNAウイルス特異的なVirome解析パイプラインの構築. 第165回日本獣医学会学術集会, 神奈川. (2022) [ポスター発表]

北尾晃一、早川卓志、宮沢孝幸、中川草. 単孔類ハリモグラのゲノムにみられるレトロウイルスの活発な内在化. 日本進化学会, 静岡. (2022) [ポスター発表]

上田真保子、小野悠介、隅山健太、三橋里美、三橋弘明、中川草. 筋細胞の融合にかかわる内在性レトロウイルス由来の新規遺伝子. 日本進化学会, 静岡. (2022) [口頭発表]

Kosuke Takada, Mahoko Takahashi Ueda, Shintaro Shichinohe Tokiko Watanabe, So Nakagawa. Genomic diversity of SARS-CoV-2 can be accelerated by an amino acid substitution in the non-structural protein 14. 第23回日本RNA学会年会, 京都. (2022) [口頭発表]

Koichi Kitao, Takayuki Miyazawa, So Nakagawa. Identification of conserved endogenous retroviral genes in monotremes (egg-laying mammals). ISEGB2022. Online. 3/12-13, 2022.

2021

庄司日和、北尾晃一、宮沢孝幸、中川草. ウイルスから獲得した胎盤形成遺伝子syncytinの新世界ザルにおける機能比較. 第44回日本分子生物学会年会. 横浜、12/1-3, 2021

Satomi Mitsuhashi, So Nakagawa, Mitsuru Sasaki-Honda, Hidetoshi Sakurai, Martin C. Frith and Hiroaki Mitsuhashi. Nanopore direct RNA sequencing detects novel DUX4-activated repeats and isoforms in human muscle cells. 第44回日本分子生物学会年会. 横浜、12/1-3, 2021

竹内恒、池田幸樹、千田美紀、原田彩佳、奥脇弘次、福澤薫、中川草、長瀬里沙、今井美咲、廣田佳久、佐々木敦朗、千田俊哉. 生命の可能性を体現するGTPレジリエンスの分子進化機構の解析. 第44回日本分子生物学会年会. 横浜、12/1-3, 2021

Sadayuki Ohkura, Masumi Shimizu, Masayuki Horie, So Nakagawa, Haruka Osanai, Yoshitaka Miyagawa, and Rimpei Morita. Capsid-dependent restriction of retroviruses by species-specific host factors, including TRIM5α and CPSF6, in bat cell lines. 第68回 日本ウイルス学会学術集会. 神戸. 11/16 - 18, 2021

Kosuke Takada, Mahoko Takahashi Ueda, Tokiko Watanabe, So Nakagawa. Genomic diversity of SARS-CoV-2 can be accelerated by a mutation in the nsp14 gene. 第68回 日本ウイルス学会学術集会. 神戸. 11/16 - 18, 2021

Koichi Kitao, So Nakagawa, Takayuki Miyazawa. An RNA element, SPRE, found in endogenous retroviral syncytin genes. 5th Uppsala Transposon Symposium. オンライン. 10/7 - 8, 2021

中川草. ゲノム解析から見えてくる日本の新型コロナウイルスの感染動向. 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2021)、オンライン、9/27-29、2021

中川草. 大規模塩基配列を活用したウイルス進化解析. 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2021)、オンライン、9/27-29、2021

山辺真幸、中川草、脇田玲. 新型コロナウイルスゲノム系統樹の3次元可視化. 第49回可視化情報シンポジウム. 9/9-11, 2021

アートコンテスト大賞受賞

北尾晃一、中川草、宮沢孝幸. 哺乳類の内在性レトロウイルスに見いだされたRNAシスエレメントの研究. 日本遺伝学会​　第93回大会、オンライン、9/8-10, 2021

庄司日和、北尾晃一、宮沢孝幸、中川草. 受容体の配列解析によるウイルス由来遺伝子syncytinの進化モデルの検証. 日本遺伝学会​　第93回大会、オンライン、9/8-10, 2021

2021年度 Young Best Poster賞

Masaki Yamabe, So Nakagawa, Akira Wakita. Time-space-based phyologenetic analysis of SARS-CoV-2. VIZBI 2021. オンライン. 3/24 - 26, 2021

2020

中川草. 哺乳類ゲノムに内在化するウイルスに由来する配列. 第43回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2020)、オンライン、12/3、2020

松沢歩、李知英、中川草、三橋里美、高地雄太、石野（金児）知子、石野史敏. ヒトゲノムで機能を獲得したHERV由来配列の探索. 第43回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2020)、オンライン、12/3、2020

上田真保子、Kirill Kryukov、三橋里美、三橋弘明、 中川草. 哺乳類ゲノムに内在するウイルス様配列の進化と機能. 日本進化学会第22回大会、オンライン、9/6, 2020

小嶋将平 、吉川剛平 、伊東潤平 、中川草 、堀江真行、川野秀一、朝長啓造、Nicholas F. Parrish. ヒトゲノムにおけるウイルス配列挿入の歴史: k-mer出現頻度から読み解く. 日本進化学会第22回大会、オンライン、9/6, 2020

中川草. 大量シークエンスデータを活用したウイルス進化研究 〜新型コロナウイルスを含めて〜. 日本進化学会第22回大会、オンライン、9/6, 2020

2019

中川草、上田真保子. 哺乳類ゲノムに存在するレトロウイルス様タンパク質をコードする配列の比較ゲノム進化解析. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

松沢歩、李知英、中川草、石野（金児）知子、石野史敏. ヒトゲノムで機能を獲得したHERV由来配列の探索. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

北尾晃一、水野拓也、中川草、宮沢孝幸. イヌメラノーマで高発現する内在性レトロウイルス由来遺伝子の探索. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

今⻄規、中川草、木村亮介、瀧靖之、竹内光、安藤寿康、ゲノムモンタージュ・プロジェクト. 個人ゲノム情報に基づくヒト顔形状の予測. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

大野歩、梅澤和夫、Kirill Kryukov、中川草、浅井さとみ、宮地勇人、今西規. ナノポアDNAシークエンサーを用いた薬剤耐性菌同定技術. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

Kirill Kryukov, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa, Tadashi Imanishi. NAF - data compression for next generation of molecular sequence databases. 第42回 日本分子生物学会年会 (MBSJ2019)、福岡、12/3-6、2019

麻生川稔、大野歩、中川草、落合恵理子、片平泰弘、須藤恵美、大澤資樹、杉澤正俊、今西規. MinIONを用いたDNA型判定の試み (その2). 日本法科学技術学会 第25回学術集会、東京、11/7-8, 2019

So Nakagawa. Massive nucleotide sequence data analysis reveals the nature of viruses. 第67回日本ウイルス学会学術集会、東京、10/29-31, 2019

小嶋将平、吉川剛平、伊藤潤平、中川草、堀江真行、川野秀一、朝長啓造. Machine learning-based novel approach to search endogenous viral elements in animal genomes. 第67回日本ウイルス学会学術集会、東京、10/29-31, 2019

木村亮介、宮平由香子、金城優奈、伊佐睦実、小金渕佳江、石田肇、安藤寿康、中川草、今西規. 幾何学的形態測定学を用いた三次元顔面形態の解析と遺伝率推定. 第73回日本人類学会大会、佐賀、10/12-14, 2019

中川草. 大規模DNAシーケンス時代のウイルス進化研究. 日本進化学会第21回大会、北海道、8/9, 2019

上田真保子、Kirill Kryukov、三橋里美、三橋弘明、今西規、中川草. 哺乳類ゲノムに存在するウイルス様タンパク質ドメインをコードする配列のダイナミックな進化. 日本進化学会第21回大会、北海道、8/9, 2019

Kryukov Kirill, Mahoko Takahashi Ueda, Tadashi Imanishi, So Nakagawa. A systematic survey of non-retroviral elements in eukaryote genomes. The Society for Molecular Biology & Evolution 2019 (SMBE2019), Manchester, UK, 7/, 2019

So Nakagawa. gEVE database provides possibly protein-coding sequences that are similar to viruses in 20 mammalian genomes. 3rd Annual Meeting of the EVBC, Glasgow, UK, 3/28-29, 2019

2018

中川草. 種々のバイオインフォマティクス解析で迫るウイルスと宿主の共進化. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

中川草. ホスファチジルイノシトール5-リン酸4-キナーゼ(PI5P4K)遺伝子ファミリーの分子進化解析. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

Takayuki Miyazawa, So Nakagawa, Koichi Kitao, and Kazuhiko Imakawa. Exaptation of endogenous retroviruses as functional genes in mammalian placentas. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

松尾禎之、中川草、Kirill Kryukov、今西規、広田喜一. ナノポアシークエンサーを用いた病原細菌の迅速同定を可能とするオンサイト解析パイプラインの確立. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

宮穗里江、中川草、宮沢孝幸. ニワトリにおける細網内皮症ウイルスの感染受容体の同定. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

上田真保子、クリュコフ キリル、三橋里美、三橋弘明、今西規、中川草. 哺乳類のタンパク質をコードするトランスポゾンの比較ゲノム解析. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

大野歩、梅澤和夫、クリュコフ キリル、中川草、浅井さとみ、宮地勇人、今西規. 生菌抽出法による薬剤耐性菌の迅速なゲノム診断技術の開発. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

小嶋将平、川野秀一、伊東潤平、中川草、堀江真行、朝長啓造. 内在性RNAウイルス様配列の新規検索手法の開発と新たなウイルス様配列の同定. 第41回日本分子生物学会年会、横浜、11/28-30, 2018

So Nakagawa, Mahoko Ueda. Genome-wide expression analysis for endogenous viral elements in mammalian genomes. 第66回日本ウイルス学会学術集会、京都、10/28-30, 2018

Yoriyuki Konno, Shumpei Nagaoka, Izumi Kimura, Keisuke Yamamoto, Yumiko Kagawa, Ryuichi Kumata, Hirofumi Aso, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa , Tomoko Kobayashi, Yoshio Koyanagi and Kei Sato. New World feline APOBEC3 potently controls inter-genus lentiviral transmission. 第66回日本ウイルス学会学術集会、京都、10/28-30, 2018

坂口翔一、中川草、水谷哲也、鈴木陽一、中野隆史. 新規Jeilongウイルスのゲノム・系統解析. 第71回 日本細菌学会 関西支部総会・学術講演会、大阪、10/28, 2018

So Nakagawa, Mahoko Ueda. gEVE: a database for viral “fossils” in mammalian genomes. 環境ウイルス研究集会、京都、10/27, 2018

中川草、上田真保子、Kirill Kryukov、三橋里美、三橋弘明、今西規. 真核生物ゲノムに内在化したウイルス様配列データベースgEVEを活用したトランスクリプトーム解析. 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018）、鶴岡、9/19-21, 2018

今西規、中川草、木村亮介、瀧靖之、安藤寿康. 個人ゲノム情報に基づくヒト顔形状の予測をめざして. 生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018）、鶴岡、9/19-21, 2018. 優秀口頭発表賞受賞

上田真保子、三橋里美、三橋弘明、中川草. 哺乳類のトランスポゾンに由来するタンパク質コード配列の比較ゲノム解析. 日本遺伝学会第90回大会、奈良、9/19-21, 2018

中川草、上田真保子、中野雄介、安田二朗、小柳義夫、佐藤佳、黒崎陽平. 公共データベースを活用したエボラウイルスGP遺伝子の感染効率に関与する塩基突然変異の同定. 第161回日本獣医学会学術集会、茨城、9/11-13, 2018.

So Nakagawa, Kirill Kryukov, Ayumu Ohno, Megumi Sudo, Tadashi Imanishi. A portable system for rapid bacterial composition analysis using a nanopore-based sequencer and laptop computer. The 17th Awaji International Forum on Infection and Immunity, Hyogo, 9/4-7, 2018

中川草、上田真保子、今川和彦、宮沢孝幸. 転移因子に由来する遺伝子の進化. 日本進化学会第20回大会、東京、8/22-24, 2018

三橋里美、中川草、上田真保子、今西規、三橋弘明、フリス マーティン. ナノポアシークエンサーを用いたD4Z4リピートの解析. 日本筋学会第4回学術集会、岡山、8/10-11, 2018

Mahoko Ueda, Satomi Mitsuhashi, Hiroaki Mitsuhashi, Tadashi Imanishi, So Nakagawa. Transcriptome analysis to identify genes derived from endogenous retrovirus that mediate cell-cell fusion during differentiation of mouse myoblasts. The Society for Molecular Biology & Evolution 2018 (SMBE2018), Yokohama, Japan, 7/8-12, 2018

Kirill Kryukov, Mahoko Takahashi Ueda, Tadashi Imanishi, So Nakagawa. Non-retroviral virus-like elements in eukaryotic genomes. The Society for Molecular Biology & Evolution 2018 (SMBE2018), Yokohama, Japan, 7/8-12, 2018

So Nakagawa, Mahoko Takahashi Ueda, Yohei Kurosaki, Yusuke Nakano, Taisuke Izumi, Olamide K. Oloniniyi, Jiro Yasuda, Yoshio Koyanagi, and Kei Sato. Molecular evolutionary analysis of Ebola virus glycoprotein identified two amino acid mutations that affect viral infectivity. The Society for Molecular Biology & Evolution 2018 (SMBE2018), Yokohama, Japan, 7/8-12, 2018

Yohei Kurosaki, Mahoko Takahashi Ueda, Yusuke Nakano, Jiro Yasuda, Yoshio Koyanagi, Kei Sato, So Nakagawa. Different effects of two mutations on the infectivity of Ebola virus glycoprotein in nine mammalian species. The Negative Strand Virus 2018 (NSV2018), Verona, Italy, 6/17-22, 2018

Shoichi Sakaguchi, Rie Koide, So Nakagawa, Takayuki Miyazawa, Tetsuya Mizutani. Epidemiologic survey of the feline paramyxovirus infection in Japan. 12th China-Japan International Conference of Virology, Wuhan, China 5/18-19, 2018

2017

中川草. ホスファチジルイノシトール5-リン酸4-キナーゼ(PI5P4K)遺伝子ファミリーの分子進化. 2017年度生命科学系学会合同年次大会、神戸、12/6 - 9, 2017

上田真保子、三橋里美、三橋弘明、今西規、中川草. 細胞融合にかかわる内在性レトロウイルス由来遺伝子の同定

2017年度生命科学系学会合同年次大会、神戸、12/6 - 9, 2017

佐藤海、大友麻子、上田真保子、杉山純也、小野鈴花、三井駿、中川草、秦野伸二. N末端自己相互作用ドメインのALS2疾患原因変異は、ALS2の正常な多量体形成やエンドソーム局在を阻害する. 2017年度生命科学系学会合同年次大会、神戸、12/6 - 9, 2017. Poster

谷利爵公、中川草、宮沢孝幸. ヒト内在性レトロウイルスWの3'末端によるシンシチン１の発現増強. 2017年度生命科学系学会合同年次大会、神戸、12/6 - 9, 2017. Poster

So Nakagawa, Mahoko Ueda, Kryukov Kirill, Tadashi Imanishi. Genome-wide analysis of endogenous viral elements in eukaryotic genomes. 第65回日本ウイルス学会学術集会、大阪、10/28-30, 2017.

Akira Gotoh Hashimoto, Rokusuke Yoshikawa, So Nakagawa, Munehiro Okamoto, Takayuki Miyazawa. Dual infection of two simian foamy virus serotypes in Japanese macaques. 第65回日本ウイルス学会学術集会、大阪、10/28-30, 2017.

中川草. エボラウイルスの感染効率に関与するアミノ酸置換の発見とその生物学的意義の考察. 第6回生命医薬情報学連合大会（IIBMP 2017）、札幌、 9/27-29, 2017

So Nakagawa. Genome-Wide Analyses of Endogenous Viral Elements in Mammalian Genomes Using the gEVE Database and Next-generation DNA Sequencing Data. 29th International Conference of the Korean Society for Molecular and Cellular Biology (KSMCB), Seoul, 9/12-14, 2017

下出紗弓, 中川草, 金村優香, 宮沢孝幸. 内在性レトロウイルスによるイエネコゲノム多様性の評価. 第160回日本獣医学会学術集会、鹿児島、9/13-15, 2017

中川草、上田真保子、Kryukov Kirill、今西規. ウイルスが形作る生物進化. 日本進化学会第19回大会、京都、8/24-26, 2017

下出紗弓、中川草、金村優香、宮沢孝幸. 内在性レトロウイルスを指標とした日本国内への欧米ネコ流入の評価. 日本進化学会第19回大会、京都、8/24-26, 2017

So Nakagawa. Transcriptome analysis to identify expressed sequences derived from endogenous viral elements. IUMS Congresses 2017, Singapore, 7/17-21, 2017, Poster.

Sayumi Shimode, So Nakagawa, Takayuki Miyazawa. Tracing the ancient cat's migration by analyzing retroviral integration sites. IUMS Congresses 2017, Singapore, 7/17-21, 2017, Poster.

Mahoko Takahashi Ueda, Yohei Kurosaki, Taisuke Izumi, Yusuke Nakano, Olamide K. Oloniniyi, Jiro Yasuda, Yoshio Koyanagi, Kei Sato, So Nakagawa. Functional mutations in spike glycoprotein of Zaire ebolavirus associated with an increase in infection efficiency. SMBE 2017, Austin, Texas, 7/1-6, 2017, Poster.

Satomi Mitsuhashi, Kirill Kryukov, So Nakagawa, Tadashi Imanishi. A portable system for rapid bacterial composition analysis using a nanopore-based sequencer. 12th International Workshop on Advanced Genomics, 6/27-29, 2017, Poster.

So Nakagawa. gEVE, genome-scale endogenous viral element database, and its applications. NIG International Symposium 2017 Commemorating the 30th Anniversary of DDBJ, 5/27-29, 2017

三橋里美、中川草. 何分で病原菌を同定できるのか：ナノポアシークエンス技術を活用したポータブルかつ迅速な微生物同定システム. NGS現場の会 第五回研究会, 仙台、5/22-24, 2017

中川草、上田真保子. NGSを活用したゲノムに内在化するウイルス由来機能配列の探索. NGS現場の会 第五回研究会, 仙台、5/22-24, 2017, Poster

2016

So Nakagawa, Mahoko Ueda Takahashi. Transcriptome analysis to identify expressed sequences derived from endogeouns viral elements. 28th International Workshop on Retroviral Pathogenesis, New Orleans, 12/5-9, 2016, Oral.

中川草、上田真保子. 哺乳類ゲノムに内在化するウイルス由来の配列の比較トランスクリプトーム解析. 第39回日本分子生物学会年会, 横浜, 11/30-12/2, 2016 [ポスター発表]

橋本暁, 吉川禄助, 中川草, 岡本宗裕, 宮沢孝幸. 非病原性霊長類レトロウイルスのエンベロープ遺伝子の進化とアジアのマカク属サルの移動経路の解明への応用. 第39回日本分子生物学会年会, 横浜, 11/30-12/2, 2016 [ポスター発表]

上田真保子、黒崎陽平、泉泰輔、中野雄介、Oloniniy K. Olamide、安田二郎、小柳義夫、佐藤佳、中川草. エボラウイルス糖蛋白質（GP）の82番目と544番目のアミノ酸変異は感染効率に関与する. 第39回日本分子生物学会年会, 横浜, 11/30-12/2, 2016 [ポスター発表]

森田一輝, 永松健, 中川草, 杉本潤, 川名敬, 大須賀穣, 藤井知行. 合胞体栄養膜細胞分化モデルを用いた内在性レトロウイルスの網羅的発現解析. 第24回日本胎盤学会学術集会 第34回日本絨毛性疾患研究会, 和歌山, 11/25-26

杉本潤, Danny Schust, 中川草, 小田高也, 陣野吉廣. マウスサプレシン遺伝子の単離・同定. 第24回日本胎盤学会学術集会 第34回日本絨毛性疾患研究会, 和歌山, 11/25-26

中川草、上田真保子. 哺乳類ゲノムに内在化するウイルス由来の配列データベースgEVEとその活用方法. 日本遺伝学会 第８８回大会、三島、9/7-10, 2016 [口頭発表]

小出りえ、坂口翔一、桑原千恵子、酒井沙知、中川草、谷利爵公、浅井健一、川上和夫、宮沢孝幸. ネコモルビリウイルスの交差中和試験による血清学的比較. 第159回日本獣医学会学術集会, 神奈川, 9/6-8, 2016

坂口翔一、大松勉、田向健一、杉山和寿、中川草、Kirill Kryukov、片山幸枝、岡田貴志、土赤忍、岸本麻衣、粉川幸樹、今西規、宮沢孝幸、水谷哲也. ネコパラミクソウイルスの国内初の検出. 第159回日本獣医学会学術集会, 神奈川, 9/6-8, 2016

坂口翔一、谷利爵公、藤村正人、中川草、宮沢孝幸. 尿から分離されたネコフォーミーウイルスの性状および遺伝学的解析. 第159回日本獣医学会学術集会, 神奈川, 9/6-8, 2016

吉川禄助、坂口翔一、中川草、中村紳一朗、阪脇廣美、兼子明久、三浦智行、鈴木樹理、岡本宗裕、宮沢孝幸. サルレトロウイルス5型感染によるニホンザル血小板減少症. 第159回日本獣医学会学術集会, 神奈川, 9/6-8, 2016

中川草、上田真保子. 哺乳類ゲノムに内在化するウイルス由来の比較トランスクリプトーム解析. 日本進化学会 第１８回東京大会、東京（東京工業大学大岡山キャンパス）、8/25-28, 2016 [ポスター発表]

Mahoko Ueda, Yohei Kurosaki, Taisuke Izumi, Yosuke Nakano, Olamide K. Oloniniyi, Jiro Yasuda, Yoshio Koyanagi, Kei Sato, and So Nakagawa. Functional mutations in spike glycoprotein of Zaire ebolavirus associated with an increase in infection efficiency. 日本進化学会 第１８回東京大会、東京（東京工業大学大岡山キャンパス）、8/25-28, 2016 [口頭発表]

So Nakagawa, Mahoko U Takahashi. gEVE: a genome-based endogenous viral element database provides open reading frame sequences derived from viruses in 20 mammalian genomes. International Congress on Transposable Elements (ICTE) 2016, San Malo (Saint-Malo’s Convention Center), France, 4/16-19, 2016, Poster.

2015

上田真保子、泉泰輔、佐藤佳、中川草

エボラウィルス糖蛋白質（GP）遺伝子の分子進化解析

第38回 日本分子生物学会年会・第88回 日本生化学会大会 合同大会、神戸（神戸ポートアイランド）、12/1-4, 2015 [口頭発表]

下出紗弓、中川草、宮沢孝幸

ネコ内在性レトロウイルスの獲得と宿主機能へ及ぼした影響

第38回 日本分子生物学会年会・第88回 日本生化学会大会 合同大会、神戸（神戸ポートアイランド）、12/1-4, 2015 [ポスター発表]

中川草、上田真保子

哺乳類のゲノムに内在化したウイルス由来の配列の発現解析

第38回 日本分子生物学会年会・第88回 日本生化学会大会 合同大会、神戸（神戸ポートアイランド）、12/1-4, 2015 [ポスター発表]

上田真保子、中川草

内在性ウイルス由来の配列のゲノム進化解析

日本進化学会 第17回大会、東京（中央大学）、8/20-24, 2015 [口頭発表]

中川草、上田真保子

gEVE, an endogenous viral elements (EVEs) database, facilitates the evolutionary studies of functional EVEs in various mammalian species

日本進化学会 第17回大会、東京（中央大学）、8/20-24, 2015 [ポスター発表]

So Nakagawa

Mammalian endogenous viral element database

SMBE 2015, Vienna, Austria 7/12-16, 2015 [ポスター発表]

Sayumi Shimode, So Nakagawa, Takayumi Miyazawa

Identification of endogenous retrovirus in the fixation process to cat genomes

SMBE 2015, Vienna, Austria 7/12-16, 2015 [ポスター発表]

中川草

NGSを活用して宿主で機能するウイルス由来の遺伝子を探索する

NGS現場の会 第四回研究会、筑波（つくば国際会議場）、7/1-3, 2015 [口頭発表]

So Nakagawa, Mahoko U Takahashi, Tadashi Imanishi

Comprehensive identification of endogenous viral elements in 20 mammalian genomes.

The 11th International Workshop on Advanced Genomics, Tokyo, 5/20-22, 2015 [Poster presentation]

2014

中川草

哺乳類のゲノムに内在化するウイルス由来の配列の比較解析

第37回日本分子生物学会, 神戸, 11/25, 2014 [口頭発表]

中川草

次世代シーケンサを用いたウシ胎盤形成に関与する内在性ウイルス由来の遺伝子の分子進化解析

第３回生命医薬情報学連合大会, 仙台, 10/2-4, 2014 [口頭発表]

中川草

ゲノムに内在化したウイルス由来の配列の比較ゲノム解析

第86回 日本遺伝学会, 長浜, 9/17-19, 2014 [口頭発表]

中川草

哺乳類のゲノムに内在化したウイルス由来の配列データベース

第16回 日本進化学会, 高槻, 8/21-24, 2014 [口頭発表]

ワークショップW5（ウイルスと宿主の共進化のダイナミクス）を名古屋市立大の鈴木善幸先生と企画しました

中川草

内在性ウイルスのデータベース作成に向けて

第17回日本レトロウイルス研究会夏期セミナー, 熱海, 7/3-5, 2014 [口頭発表]

2013

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Imanishi, T., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

第36回日本分子生物学会, 神戸, 12/3-6, 2013 [ポスター発表]

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Imanishi, T., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

生命医薬情報連合大会, 東京, 10/28-31, 2013 [口頭、ポスター発表]

中川草、今西規、溝上雅史、坂本直哉

C型肝炎治療に伴う肝病態の進展に関わる宿主因子の解析

NGS現場の会、神戸、9/4-5 [ポスター発表]

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

SMBE 2013, Chicago, USA 7/7-11, 2013 [ポスター発表]

中川草

内在性ウイルス研究のためのバイオインフォマティクス

生命情報科学若手の会 第４回研究会, 愛知, 3/1-3, 2013 [口頭・ポスター発表]

2011

SMBE 2011 Annual Meeting, Kyoto, Japan [口頭発表]

中川草、唄花子、金野俊洋、櫻井敏博、宮沢孝幸、五條堀孝、今川和彦

次世代シーケンサーを活用したウシの胎盤発生に関与する内在性ウイルス由来の遺伝子の探索

NGS現場の会 第１回研究会、熱海[ポスター]

2010

中川草、金野俊洋、唄花子、櫻井敏博、星野重樹、宮沢孝幸、今川和彦、五條堀孝

次世代シーケンサーを活用したウシの胎盤発生に関与する内在性ウイルス由来の遺伝子の探索

生命情報科学若手の会 第２回研究会、三島[口頭＆ポスター]

中川草、新村芳人、三浦謹一郎、五條堀孝

原核生物における蛋白質の翻訳開始機構の進化

第12回 日本進化学会大会、東京 [口頭発表]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

SMBE 2010 Annual Meeting, Lyon, France [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative genomic study on dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB2010), Tainan, Taiwan [口頭発表]

Best Oral Presentation Award

2009

中川草、新村芳人、三浦謹一郎、五條堀孝

真正細菌と古細菌における蛋白質翻訳開始機構の多様性

第11回 日本進化学会大会、札幌 [口頭発表]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Clemente, J. C., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative genomic analysis of the Shine-Dalgarno sequences in prokaryotes.

3rd International Biocuration Conference. Berlin, Germany [ポスター]

Clemente, J. C., Nakagawa, S., Ikeo, K., and Gojobori, T.

Genome Network Project: An Integrated Genomic Platform

3rd International Biocuration Conference. Berlin, Germany [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Clemente, J. C., Miura, K., and Gojobori, T.

Diversity of the Shine-Dalgarno sequence in prokaryotes.

Annual Meeting of the Society of Genome Microbiology, Japan. Tokyo, Japan [口頭＆ポスター]

2008

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative evolutionary analysis of the sequences upstream of the translation initiation codon in prokaryotes.

Annual Meeting for the Society of Evolutionary Studies. Tokyo, Japan [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., and Miura, K.

Diversity of preferred nucleotide sequences around the translation initiation codon in eukaryote genomes

International Congress of Genetics 2008, Berlin, German [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., Tanaka, H., and Miura, K.

Comparative genomic analysis of the nucleotide sequences upstream of the translation initiation codon in prokaryotes

SMBE 2008 Annual Meeting, Barcelona, Spain [ポスター]

中川草、谷口丈晃、藤渕航

網羅的mRNA絶対定量のためのパイロプライマーの開発

第5回ライフサーベイヤシンポジウム、名古屋[ポスター]

2007

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

285種の原核生物を用いた翻訳制御配列の塩基出現頻度解析

日本遺伝学会第79回大会、岡山[口頭]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., Tanaka, H., and Miura, K.

Similarities and differences in the sequences around the translation initiation codon among 47 eukaryote species

SMBE 2007 Annual Meeting, Halifax, Canada. [ポスター]

2006

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

真核生物におけるタンパク質翻訳開始に関与する塩基配列の比較進化解析

日本分子生物学2006フォーラム、名古屋[ポスター]

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

48種の真核生物を用いた開始コドン周辺の塩基出現頻度の比較ゲノム解析

日本遺伝学会第78回大会、筑波[口頭]

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

真核生物における開始コドン周辺の塩基出現頻度の比較進化解析

日本進化学会2006年大会、東京[ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., and Tanaka, H.

Comparative evolutionary analysis of the sequences around the translation initiation site among various eukaryotic species

SMBE 2006 Annual Meeting, Genomes, Evolution, and Bioinformatics. Arizona, USA. [ポスター]

2005

中川草、新村芳人、田中博

真核生物の完全長cDNAデータベースを用いた非翻訳領域の塩基出現頻度の比較ゲノム解析

第28回日本分子生物学会年会、福岡[ポスター]

2004

Nakagawa, S., Ogishima, S., Hase, T., Suzuki, Y., and Tanaka, H.

The analysis between functions and densities in yeast intercomplex protein-protein interactions

The Fifteenth International conference on Genome Informatics, P131-1,2 2004. Yokohama [ポスター]

中川草、荻島創一、長谷武志、鈴木 泰博、田中 博

酵母におけるタンパク質複合体間の相互作用の性質

第27回日本分子生物学会、神戸[ポスター]

中川草、鈴木泰博、荻島創一、長谷武志、田中博

酵母のタンパク質相互作用の細胞内局在ごとの分析

平成16年度数理モデル化と問題解決シンポジウム, p361-366、名古屋[ポスター]

中川草、鈴木泰博、荻島創一、長谷武志、田中博

酵母におけるタンパク質複合体間相互作用の数理的解析

CBI学会2004年大会、東京[ポスター]

（サイエンスコミュニケーション）

池尾一穂，中川草，金城その子，五條堀孝

病気をシステムとして理解する-疾患情報モデルの構築

文部科学省科学研究費特定領域研究"応用ゲノム"主催市民講座"ゲノムがわかる 病気がわかる"．東京．2009年１月．[ポスター]

Nakagawa, S.

Innovative R&D on Biomedical Science in Japan

Ubiquitous Media: Asian Transformations (UMAT) 2007, Tokyo [Oral presentation]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

15th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles, Marseille, France [口頭発表]

Nakagawa, S., Bai, H., Konno, T., Sakurai, T., Miyazawa, T., Gojobori, T., and Imakawa, K.

Dynamic Evolution of Endogenous Retrovirus-derived Genes for Placentation: An RNA-seq Study in Bos taurus

5th Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB), Korea

Nakagawa, S., Bai, H., Konno, T., Sakurai, T., Miyazawa, T., Gojobori, T., and Imakawa, K.

Dynamic evolution of endogenous retrovirus-derived genes for placentation: An RNA-seq study of trophoblast cell in Bos taurus

2013

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Imanishi, T., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

第36回日本分子生物学会, 神戸, 12/3-6, 2013 [ポスター発表]

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Imanishi, T., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

生命医薬情報連合大会, 東京, 10/28-31, 2013 [口頭、ポスター発表]

中川草、今西規、溝上雅史、坂本直哉

C型肝炎治療に伴う肝病態の進展に関わる宿主因子の解析

NGS現場の会、神戸、9/4-5 [ポスター発表]

Nakagawa, S., Gisselbrecht, S. S., Rogers, J. M., Hartl, D. L. and Bulyk, M. L.

DNA Binding Specificity Changes in the Evolution of Forkhead Box Proteins

SMBE 2013, Chicago, USA 7/7-11, 2013 [ポスター発表]

中川草

内在性ウイルス研究のためのバイオインフォマティクス

生命情報科学若手の会 第４回研究会, 愛知, 3/1-3, 2013 [口頭・ポスター発表]

2011

SMBE 2011 Annual Meeting, Kyoto, Japan [口頭発表]

中川草、唄花子、金野俊洋、櫻井敏博、宮沢孝幸、五條堀孝、今川和彦

次世代シーケンサーを活用したウシの胎盤発生に関与する内在性ウイルス由来の遺伝子の探索

NGS現場の会 第１回研究会、熱海[ポスター]

2010

中川草、金野俊洋、唄花子、櫻井敏博、星野重樹、宮沢孝幸、今川和彦、五條堀孝

次世代シーケンサーを活用したウシの胎盤発生に関与する内在性ウイルス由来の遺伝子の探索

生命情報科学若手の会 第２回研究会、三島[口頭＆ポスター]

中川草、新村芳人、三浦謹一郎、五條堀孝

原核生物における蛋白質の翻訳開始機構の進化

第12回 日本進化学会大会、東京 [口頭発表]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

SMBE 2010 Annual Meeting, Lyon, France [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative genomic study on dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB2010), Tainan, Taiwan [口頭発表]

Best Oral Presentation Award

2009

中川草、新村芳人、三浦謹一郎、五條堀孝

真正細菌と古細菌における蛋白質翻訳開始機構の多様性

第11回 日本進化学会大会、札幌 [口頭発表]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Clemente, J. C., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative genomic analysis of the Shine-Dalgarno sequences in prokaryotes.

3rd International Biocuration Conference. Berlin, Germany [ポスター]

Clemente, J. C., Nakagawa, S., Ikeo, K., and Gojobori, T.

Genome Network Project: An Integrated Genomic Platform

3rd International Biocuration Conference. Berlin, Germany [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Clemente, J. C., Miura, K., and Gojobori, T.

Diversity of the Shine-Dalgarno sequence in prokaryotes.

Annual Meeting of the Society of Genome Microbiology, Japan. Tokyo, Japan [口頭＆ポスター]

2008

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Comparative evolutionary analysis of the sequences upstream of the translation initiation codon in prokaryotes.

Annual Meeting for the Society of Evolutionary Studies. Tokyo, Japan [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., and Miura, K.

Diversity of preferred nucleotide sequences around the translation initiation codon in eukaryote genomes

International Congress of Genetics 2008, Berlin, German [ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., Tanaka, H., and Miura, K.

Comparative genomic analysis of the nucleotide sequences upstream of the translation initiation codon in prokaryotes

SMBE 2008 Annual Meeting, Barcelona, Spain [ポスター]

中川草、谷口丈晃、藤渕航

網羅的mRNA絶対定量のためのパイロプライマーの開発

第5回ライフサーベイヤシンポジウム、名古屋[ポスター]

2007

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

285種の原核生物を用いた翻訳制御配列の塩基出現頻度解析

日本遺伝学会第79回大会、岡山[口頭]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Gojobori, T., Tanaka, H., and Miura, K.

Similarities and differences in the sequences around the translation initiation codon among 47 eukaryote species

SMBE 2007 Annual Meeting, Halifax, Canada. [ポスター]

2006

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

真核生物におけるタンパク質翻訳開始に関与する塩基配列の比較進化解析

日本分子生物学2006フォーラム、名古屋[ポスター]

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

48種の真核生物を用いた開始コドン周辺の塩基出現頻度の比較ゲノム解析

日本遺伝学会第78回大会、筑波[口頭]

中川草、新村芳人、田中博、五條堀孝、三浦謹一郎

真核生物における開始コドン周辺の塩基出現頻度の比較進化解析

日本進化学会2006年大会、東京[ポスター]

Nakagawa, S., Niimura, Y., and Tanaka, H.

Comparative evolutionary analysis of the sequences around the translation initiation site among various eukaryotic species

SMBE 2006 Annual Meeting, Genomes, Evolution, and Bioinformatics. Arizona, USA. [ポスター]

2005

中川草、新村芳人、田中博

真核生物の完全長cDNAデータベースを用いた非翻訳領域の塩基出現頻度の比較ゲノム解析

第28回日本分子生物学会年会、福岡[ポスター]

2004

Nakagawa, S., Ogishima, S., Hase, T., Suzuki, Y., and Tanaka, H.

The analysis between functions and densities in yeast intercomplex protein-protein interactions

The Fifteenth International conference on Genome Informatics, P131-1,2 2004. Yokohama [ポスター]

中川草、荻島創一、長谷武志、鈴木 泰博、田中 博

酵母におけるタンパク質複合体間の相互作用の性質

第27回日本分子生物学会、神戸[ポスター]

中川草、鈴木泰博、荻島創一、長谷武志、田中博

酵母のタンパク質相互作用の細胞内局在ごとの分析

平成16年度数理モデル化と問題解決シンポジウム, p361-366、名古屋[ポスター]

中川草、鈴木泰博、荻島創一、長谷武志、田中博

酵母におけるタンパク質複合体間相互作用の数理的解析

CBI学会2004年大会、東京[ポスター]

（サイエンスコミュニケーション）

池尾一穂，中川草，金城その子，五條堀孝

病気をシステムとして理解する-疾患情報モデルの構築

文部科学省科学研究費特定領域研究"応用ゲノム"主催市民講座"ゲノムがわかる 病気がわかる"．東京．2009年１月．[ポスター]

Nakagawa, S.

Innovative R&D on Biomedical Science in Japan

Ubiquitous Media: Asian Transformations (UMAT) 2007, Tokyo [Oral presentation]

Nakagawa, S., Niimura, Y., Miura, K., and Gojobori, T.

Dynamic evolution of translation initiation mechanisms in prokaryotes.

15th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles, Marseille, France [口頭発表]

Nakagawa, S., Bai, H., Konno, T., Sakurai, T., Miyazawa, T., Gojobori, T., and Imakawa, K.

Dynamic Evolution of Endogenous Retrovirus-derived Genes for Placentation: An RNA-seq Study in Bos taurus

5th Asian Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB), Korea

Nakagawa, S., Bai, H., Konno, T., Sakurai, T., Miyazawa, T., Gojobori, T., and Imakawa, K.

Dynamic evolution of endogenous retrovirus-derived genes for placentation: An RNA-seq study of trophoblast cell in Bos taurus