植物ゲノム情報学

細胞内には遺伝子やタンパク質など多くの分子があり、これらをまとめて調べたデータをオミックスデータといいます。多数の情報を全体として理解する鍵が、点（ノード）と線（エッジ）で関係を表す「ネットワーク」です。DiffCorr（Fukushima, 2013; Fukushima and Nishida, 2016）は、通常条件とストレス条件それぞれで遺伝子どうしの相関からネットワークを作り、その違いを比較して重要な因子の手がかりを見つける方法です（Ichihashi, Fukushima et al. 2018）。ネットワーク解析は現在も発展が続いている分野です。

植物は、乾燥や高温などのきびしい環境にさらされると、多くの「環境に強くなる遺伝子」を使って生きのびています。将来、環境に強い作物を作るためには、どの遺伝子が大切なのか、またそれを動かすスイッチ役の遺伝子は何かを見つける必要があります。そのために、集積された過去の実験データをうまく整理し、そこから新しい発見をする（＝知識化する）研究が注目されています。私たちの研究室では、モデル植物シロイヌナズナの公開データをまとめて分析し、遺伝子どうしのつながりを調べています。さらに、さまざまな環境ストレスで働く遺伝子を整理した「遺伝子アトラス＝AtSRGA (https://x.gd/RJxxD」の開発を進めています。