解説

• A-Co-Labo研究者の履歴書 #6  (flasko 研究者紹介)

• ツボカビに関する解説（プレスリリース）

• 定量生態学のすゝめ：龍谷理工ジャーナル

• 大規模相互作用網に対するノンパラメトリック手法（EDM, MDR S-map)の解説（ESJ関東地区会、三木）ここ

• 博士論文 要旨 

• 経験的アプローチとの連携という呪縛あるいは希望の光：JSMB Newsletter No. 75, pp. 4–7, 2015

• 「K値」プレプリント原稿に対するコメント：ウェブログ

講義資料・自習用資料

• 「Rではじめよう！生態学・環境科学のためのデータ分析超入門」（共立出版）サポートサイト　https://tksmiki.github.io/eco_env_R/

• 生態系科学手法動画ポータル　https://sites.google.com/view/ecology-method-portal/home

• Pythonを用いた数理生態学      https://sites.google.com/view/python3-math-ecol/

• （台湾大学）C言語を用いた生命科学・生態学モデリング（英語）

• （京都大学）Rを用いた多変量解析の基礎と微生物多機能性評価（バイオログ解析）への応用       https://sites.google.com/view/cer-ecoplate/

　　→もと論文のコードとデータ：https://github.com/tksmiki/ecoplate2018_ER

• （龍谷大学実習用）Rを用いた多変量データの前処理と生物多様性の定量化      https://sites.google.com/view/diversity-multivariate/Ryukoku2019 

•  （龍谷大学実習・研究室用）多変量データの前処理と生物多様性の定量化 2020 （一つ上の資料の簡易版）    https://sites.google.com/view/diversity-analysis2020/ 

• （龍谷大学実習・研究室用）多変量データの前処理と生物多様性の定量化 2021　 https://sites.google.com/view/ru-eee-diversity2021/Ryukoku2021

• 計算機基礎実習２（2021）https://sites.google.com/view/ryukoku-r2021/home

• データサイエンスおよび演習（from 2021）https://sites.google.com/view/data-science2021/home

•  BIOLOG統計解析ガイド （準備中） 

• C言語での数値計算時に多数のパラメータセットでのコンパイル・実行をRStudio上で自動化する方法（準備中）

• 理論生態学トピックス：https://sites.google.com/view/theoretical-ecol/

R・統計・機械学習リンク集

• R環境設定マニュアル（特に32ページに注意）

• 統計第一歩

• オンラインツール Rstudio cloud

• R-Tips: http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r.html

• Rで統計解析（橋本洸哉さん）：https://sites.google.com/view/ecology-koyahashimoto/home/rde-sheng-wu-shi-yan-jie-xi

• r-EDMの使い方（京極さん）：https://sites.google.com/site/dkyogoku/redm-no-shii-fang

• r-EDMの総説論文：Ecological Research誌上およびリポジトリ

• r-EDM解説ブログ（潮さん）：https://ushio-ecology-blog.blogspot.com/2019/12/20191205blogger0004.html

• EDM解説スライド（長田さん）：https://ytosada.wixsite.com/main/pecol34

• Structural Equation Modeling: https://jslefche.github.io/sem_book/index.html

• Uglylab software: https://www.uglylab.eu/simulation-software/

• State Space modeling: https://arxiv.org/pdf/2002.02001.pdf

• スパースモデリング１ 基本：http://tekenuko.hatenablog.com/entry/2017/11/18/214317

• スパースモデリング２ adaptive lasso：http://tekenuko.hatenablog.com/entry/2017/11/02/014859

• スパースモデリング3    multi-step adaptive elastic-net (msaenet)：https://cran.r-project.org/web/packages/msaenet/vignettes/msaenet.html

英語・論文・プレゼン

• ライフサイエンスWebLSD検索（英単語と英単語の組み合わせの相性の検索、「コーパス」を選択）

• 伝わるデザイン   http://tsutawarudesign.com/ （プレゼン技術の基盤）

その他

• 日本科幻動畫電影的演進（中文）https://drive.google.com/file/d/1vtGBcRYeHbp6SUofbLh6rvb4uZW6JSJI/view?usp=sharing

EDMの解説資料